Coronavirus

Orthocoronavirinae

Orthocoronavirinae Descripción de esta imagen, también comentada a continuación Viriones de SARS-CoV . Clasificación
Escribe Virus
Dominio Riboviria
Reinado Orthornavirae
Rama Pisuviricota
Clase Pisoniviricetes
Orden Nidovirales
Suborden Cornidovirineae
Familia Coronaviridae

Subfamilia

ICTV Orthocoronavirinae

Géneros de rango inferior

Los coronavirus ( CoV ) son virus que constituyen la subfamilia Orthocoronavirinae de la familia Coronaviridae . El nombre "coronavirus", del latín que significa "virus de la corona", se debe a la aparición de viriones bajo un microscopio electrónico , con una franja de grandes proyecciones bulbosas que se asemejan a una corona solar .

Los coronavirus tienen una envoltura viral que incluye una cápside caracterizada por proteínas en forma de maza (llamadas espículas ). Tienen un genoma a ARN monocatenario (es decir, una sola cadena), a sentido positivo (grupo IV de la clasificación de Baltimore ), de 26 a 32 kilobases (lo que lo convierte en el genoma más grande entre virus a ARN ). Se clasifican entre los Nidovirales , un orden de virus que producen un conjunto anidado de ARNm subgenómicos tras la infección. De espículas , una envoltura , una cápside y una membrana contribuyen a la estructura general de todos los coronavirus. Pueden mutar y recombinarse.

Los murciélagos y las aves , como vertebrados que vuelan sangre caliente , serían los invitados ideales para que el coronavirus lidere el desarrollo y propagación del coronavirus. Los coronavirus son normalmente específicos de un taxón animal como hospedador, mamíferos o aves, dependiendo de su especie; pero a veces pueden cambiar de anfitrión como resultado de una mutación . Su transmisión de persona a persona se produce principalmente a través del contacto cercano a través de aerosoles respiratorios generados al estornudar, toser o llamar por teléfono. Se han aislado más de 500 tipos de coronavirus en murciélagos y hay más de 5,000 tipos de coronavirus.

En general, se citan siete coronavirus principales como capaces de infectar a los seres humanos . Se ha identificado un octavo: B814 (el primer coronavirus humano identificado), pero esta cepa parece no estar circulando más.

Se consideran fuentes benignas de infección cuatro coronavirus circulantes: 229E , NL63 , OC43 y HKU1 . Son la causa del 15 al 30% de los resfriados comunes.

Más recientemente, se han identificado tres tipos de coronavirus responsables de neumonía grave  :

  1. el SARS-CoV , agente patógeno del síndrome respiratorio agudo severo (SARS) 2002-2004
  2. el MERS-CoV , el del Síndrome Respiratorio de Oriente Medio de 2012
  3. el SARS-CoV-2 , el de la enfermedad coronavirus 2019 (Covid-19) apareció en China en 2019 y responsable de una pandemia grave en 2020-2021

Descubrimiento, historia

El coronavirus sido probablemente al menos cientos de millones de años, pero desde el punto de vista de la epidemiología y la historia médica, y como zoonosis es la XXI °  siglo tomaron la importancia: “cinco de los coronavirus humanos siete han sido aislados durante este siglo. Y lamentablemente, los tres últimos han entrado en nuestras vidas con el temor de una epidemia, una pandemia o la muerte ” .

Fue en 1930 en Estados Unidos cuando se observó la primera enfermedad por coronavirus, en aves de corral . Al año siguiente, un médico describió en un artículo la enfermedad que causaba dificultad respiratoria en la gallina y una disminución de la puesta y la calidad del huevo. En 1937 , se aisló el agente infeccioso, el virus de la bronquitis infecciosa aviar (IBV para Infectious Bronchitis Virus ).

En 1946 se identificó otro coronavirus, el Coronavirus de la gastroenteritis porcina transmisible (TGEV). Independientemente, en 1949 en Nueva York y 1951 en Londres , dos equipos descubrieron el virus de la hepatitis murina en un ratón paralizado.

En 1965 , se descubrió el primer coronavirus que infectaba a los humanos (cepa B814 ). Y rápidamente, le siguen otros: 229E en 1966 y OC43 en 1967 , que son la causa de resfriados más o menos graves según la gente. Al año siguiente, que se observan bajo un microscopio electrónico de June Almeida y David Tyrrell que demuestran su estructura de corona. Se establece la relación entre todos estos virus, y el término "coronavirus" se utiliza por primera vez en la revista Nature en 1968 .

Epidemia de la XXI °  siglo

Pandemia de coronavirus

El último coronavirus humano (o humanizado recientemente, probablemente de una o más cepas transportadas por murciélagos) parece haber surgido en Wuhan, China en 2019: SARS-CoV-2 . La enfermedad que provoca ( Covid-19 ) provocó la primera gran pandemia de coronavirus en pocos meses, caracterizada por un R 0 elevado (2,3 de media según las estimaciones disponibles enabril 2020, pero que parece poder llegar a 5.7); con una tasa de letalidad de 6,3 (muy variable según la edad y el contexto, superando en ocasiones el 15%).

Pandemia de coronavirus
Pandemia Con fecha de Casos confirmados Muerte Curaciones Subtipo involucrado
Epidemia de SARS 2002-2004 2002-2004 8.096 774 - Sars-Cov (SARS)
Síndrome respiratorio de Oriente Medio coronavirus 2012-2014 361 107 - MERS-CoV
Pandemia de Covid-19 (en curso) 2019-2021 + 106 903 452 (10 de febrero de 2021) + 2341010 (10 de febrero de 2021) + 59 755 076 (10 de febrero de 2021) SARS-CoV-2 (Covid-19)
Datos de la pandemia Sars-CoV-2 (2019-2021)   
Datos de la pandemia Covid-19 por país y territorio
Lugares Confirmado Muerte Restaurado % muertes por
caso confirmado 		Muertes por
millón de hab. 		Árbitro.
200+ 179723542 3.894.122 - - -
Estados Unidos 33 665 482 607,476 - - -
India - - - - -
Brasil 18,169,881 507 109 16 483 635 2,79% 2 413
Francia 5.760.002 110 858 - 1,92% 1,671
pavo 5.393.248 49,417 5.254.708 0,92% 591
Rusia 5 388 695 131.463 4 915 615 2,44% 895
Reino Unido 4.684.572 128,048 - 2,73% 1955
Italia 4.254.294 127,322 4.054.008 2,99% 2 111
Argentina 4 328 038 90 986 3 944 260 2,1% 2.025
Alemania 3,741,685 90 953 3.600.881 2,43% 1.094
España 3,773,032 80,748 - 2,14% 1,728
Colombia 4.027.016 101947 3,741,459 2,53% 2.078
Iran 3140129 83 473 2 797 105 2,66% 1.044
Polonia 2 879 336 74 917 2.651.045 2,6% 1952
México 2,487,747 231,847 1 979 823 9,32% 1.858
Ucrania 2,231,914 52.181 2,157,732 2,34% 1 226
Perú 2,036,449 191,073 1,994,330 9,38% 6,503
Indonesia - - - - -
Africa del Sur 1 877 143 59,406 1,675,827 3,16% 996
Chequia 1,666,521 30,291 1,634,010 1,82% 2.830
Países Bajos 1,678,983 17 726 - 1,06% 1.046
Chile 1,531,872 31,797 1,468,137 2,08% 1,761
Canadá 1,413,323 26 168 1 375 596 1,85% 691
Filipinas 1.378.260 24,036 1,302,814 1,74% 238
Irak 1,305,000 16 968 1,213,952 1,3% 443
Rumania 1.080.457 32,771 1.045.303 3,03% 1,673
Suecia 1.088.896 14,619 - 1,34% 1.408
Bélgica 1.081.061 25,149 - 2,33% 2.200
Pakistán 951865 22,108 896,821 2,32% 102
Portugal 869 879 17.079 823 103 1,96% 1,659
Israel 840,032 6.428 832 923 0,77% 707
Hungría 807 684 29,963 735 937 3,71% 3,067
Bangladesh 872935 13,868 794 783 1,59% 84
Japón 789,440 14 553 756,293 1,84% 115
Jordán 739,847 9.530 721,016 1,29% 914
Serbia 716,096 7.019 - 0,98% 1000
suizo 702,124 10,329 317,600 1,47% 1.220
Austria 649,922 10 697 636 923 1,65% 1214
Malasia 716,847 4 721 650,964 0,66% 149
Emiratos Árabes Unidos 620 309 1775 599,131 0,29% 189
Bandera de nepal Nepal 629,431 8 918 570 958 1,42% 294
Líbano 543,865 7 832 528 643 1,44% 1,284
Marruecos 528 180 9.265 515,030 1,75% 257
Arabia Saudita 479,390 7 730 460,338 1,61% 234
Ecuador 449,483 21 377 415,508 4,76% 1,286
Bulgaria 421339 18,013 393 870 4,28% 2.573
Grecia 418 943 12,575 363 915 3% 1,169
Bielorrusia 413,139 3,082 405,909 0,75% 330
Eslovaquia 391 456 12,502 - 3,19% 2316
Kazajstán 410 523 4.249 386,127 1,04% 232
Panamá 396,526 6.491 378,954 1,64% 1,584
Bolivia 426,748 16,329 346,879 3,83% 1,478
Croacia 359,403 8 192 350 669 2,28% 1,995
Paraguay 411 615 11 973 352,014 2,91% 1,758
Túnez 501923 16,494 340 834 3,66% 1 238
Georgia 361 484 5 228 347,653 1,45% 1.406
Azerbaiyán 335 676 4 965 329 870 1,48% 490
Costa Rica 357,523 4.567 283 935 1,28% 931
Kuwait 344,799 1,894 324,578 0,55% 412
Uruguay 360,247 5 374 332 112 1,49% 1,555
República Dominicana 319,254 3,773 261222 1,18% 363
Dinamarca 292 352 2.531 286,366 0,87% 443
Lituania 278,590 4 375 267,055 1,57% 1,568
Etiopía 275,601 4.296 257,429 1,56% 41
Egipto 278 761 15.967 207 411 5,73% 168
Irlanda 267,949 4.979 - 1,86% 1.046
Moldavia 256,387 6.180 249,381 2,41% 2 423
Guatemala 284,741 8 845 257,397 3,11% 512
Eslovenia 257,116 4.417 - 1,72% 2 137
Honduras 255.663 6.844 92,014 2,68% 739
Bahréin 264 107 1330 256 933 0,5% 891
Venezuela 264,551 3.007 245,519 1,14% 105
Armenia 224,533 4.505 216 312 2,01% 1,537
Katar 221,378 587 218,928 0,27% 222
Omán 737,830 2.639 703 940 0,36% 546
Bosnia y Herzegovina 204,936 9 653 181,199 4,71% 2 752
Sri Lanka 246 109 2,769 211,186 1,13% 129
Libia 191,476 3 183 176,869 1,66% 477
Kenia 181,239 3,538 123,462 1,95% 73
Nigeria 167,375 2 118 163,917 1,27% 11
Tailandia 232 647 1775 191 355 0,76% 27
Macedonia del Norte 155,627 5 477 149 877 3,52% 2.639
Birmania 150 714 3275 134,589 2,17% 61
Cuba 172,909 1,193 162,531 0,69% 104
Corea del Sur 153,155 2.008 144 788 1,31% 39
Letonia 137 110 2500 133,141 1,82% 1310
Albania 132.499 2 455 129,966 1,85% 813
Estonia 130,898 1,269 126,968 0,97% 958
Argelia 137,049 3.660 95 331 2,67% 89
Noruega 130,035 792 88 952 0,61% 147
Kosovo 107,571 2 249 104,791 2,09% 1 194
Kirguistán 118 106 1.958 106 858 1,66% 316
Uzbekistan 107,708 723 103,472 0,67% 22
Montenegro 101 131 1.609 98,243 1,59% 2.585
Zambia 140 620 1 855 115,898 1,32% 109
Ghana 95,259 794 93.148 0,83% 30
Finlandia 94 719 969 31.000 1,02% 176
porcelana 91 669 4.636 86,541 5,06% 3
Camerún 80,487 1320 57,008 1,64% 55
el Salvador 77,484 2 351 71,603 3,03% 366
Chipre 73 832 374 - 0,51% 328
Afganistán 111,532 4.519 66,799 4,05% 123
Mozambique 73 652 863 70 352 1,17% 29
Luxemburgo 70.586 818 69,555 1,16% 1,306
Maldivas 72,466 207 67 886 0,29% 474
Singapur 62,448 35 62,098 0,06% 6
Mongolia 102,629 482 66,602 0,47% 157
Namibia 78 723 1,279 62.026 1,62% 505
Botswana 61.457 1.069 59,616 1,74% 466
Jamaica 49,841 1.049 29,322 2,1% 363
Costa de Marfil 47,760 306 47,239 0,64% 13
Uganda 75 357 781 50 350 1,04% 18
Senegal 42 333 1,158 40 767 2,74% 73
Madagascar 42,161 905 40,450 2,15% 35
Zimbabue 43.480 1,692 37,477 3,89% 102
Sudán 36,558 2.750 30,404 7,52% 68
Angola 38,002 878 32 322 2,31% 29
Malawi 35 115 1,177 32 948 3,35% 63
República Democrática del Congo 38 936 896 28 115 2,3% 10
Camboya 44 711 475 39,314 1,06% 30
Malta 30.598 420 30,151 1,37% 903
Cabo Verde 32 192 284 31,202 0,88% 520
Australia 30,408 910 - 2,99% 37
Ruanda 33,260 397 26,734 1,19% 33
Siria 25 118 1.845 21,738 7,35% 100
Gabón 24 958 159 24.509 0,64% 79
Trinidad y Tobago 31,207 768 22,630 2,46% 561
Guinea 23,615 168 22,379 0,71% 13
Mauritania 20,473 483 19,514 2,36% 109
Eswatini 18,898 677 18.050 3,58% 602
Guayana 19 359 454 17.297 2,35% 584
Papúa Nueva Guinea 17.079 173 16,480 1,01% 19
Surinam 20 549 482 15,731 2,35% 856
Somalia 14,776 773 6,985 5,23% 70
Haití 17,710 393 12 753 2,22% 36
Mali 14 385 524 10.038 3,64% 28
Andorra 13,864 127 13 665 0,92% 1,667
Tayikistán 13 714 90 13,218 0,66% 10
Ir 13 749 128 13,379 0,93% dieciséis
Burkina Faso 13,468 167 13,290 1,24% 9
Belice 13,004 328 12,551 2,52% 875
Hong Kong 11,906 210 11 598 1,76% 28
Bahamas 12,295 241 11 230 1,96% 610
República del Congo 12,404 164 8 208 1,32% 31
Seychelles 14,620 59 13 323 0,4% 616
Djibouti 11 587 155 11,424 1,34% 162
Lesoto 11 128 329 6.445 2,96% 147
Sudán del Sur 10 688 115 10,514 1,08% 9
Guinea Ecuatorial 8.708 120 8 489 1,38% 95
Taiwán 14.389 605 - 4,2% 26
Benigno 8 170 104 8.000 1,27% 9
Nicaragua 7 877 189 - 2,4% 30
Vietnam 14 116 72 5 759 0,51% 1
Republica Centro Africana 7.139 98 5 112 1,37% 21
Timor Oriental 8.843 19 7 838 0,21% 15
Yemen 6 877 1,353 3 855 19,67% 48
Islandia 6 637 30 6 595 0,45% 84
Gambia 6.054 181 5.844 2,99% 86
Níger 5.469 193 5 178 3,53% 9
San Marino 5.090 90 4.998 1,77% 2.695
Santa Lucía 5238 84 5,084 1,6% 470
Chad 4.946 174 4 768 3,52% 11
Burundi 5.300 8 773 0,15% 1
Sierra Leona 4 816 82 3 264 1,7% 11
Eritrea 5.608 21 5.078 0,37% 6
Comoras 3 912 146 3.745 3,73% 177
Guinea-Bissau 3.825 69 3562 1,8% 37
Liechtenstein 3 031 59 2 957 1,95% 1,556
Mónaco 2.557 33 2,491 1,29% 853
Santo Tomé y Príncipe 2363 37 2316 1,57% 181
Nueva Zelanda 2 362 26 2,314 1,1% 5
Liberia 3,265 110 2 222 3,37% 23
Laos 2.060 3 1962 0,15% 0
Bután 1963 1 1,702 0,05% 1
Mauricio 1,779 18 1331 1,01% 14
Antigua y Barbuda 1,263 42 1 221 3,33% 412
Princesa de diamantes 712 14 698 1,97% 3,773
Tanzania - - - - -
Fiyi 2.549 13 636 0,51% 14
Brunei 252 3 243 1,19% 7
Barbados 236 7 218 2,97  % 24
Dominica 192 0 189 0% 0
Granada 160 1 158 0,63% 9
San Vicente y las Granadinas 98 0 81 0  % 0
Saint Kitts y Nevis 396 3 92 0,76% 54
Macao 53 0 51 0% 0
Vaticano 29 0 27 0% 0
Sahara Occidental 28 2 26 0  % 0
Islas Salomón 13 0 4 0  % 0
MS Zaandam 13 4 - 30,77% 2 187
Islas Marshall 4 0 0 0  % 0
Samoa 3 0 1 0% 0
Vanuatu 3 0 3 0% 0
Estados Federados de Micronesia 1 0 0 0  % 0

Caracterización

La taxonomía de estos nuevos virus se debate inicialmente, lo que finalmente llevó en 1975 a la creación de una nueva familia ( Coronaviridae ) y una nueva subfamilia ( Orthocoronavirinae ) por parte del Comité Internacional de Taxonomía de Virus .

Denominación

El término coronavirus (en latín corona y virus , literalmente "virus de la corona") proviene de la aparición de viriones al microscopio electrónico , caracterizado por una franja de grandes protuberancias que rodean la envoltura con apariencia de corona , por analogía con la corona solar .

Anfitriones de virus

Los ideales anfitriones para los coronavirus, como de sangre caliente que vuelan vertebrados , son los murciélagos (por Alphacoronaviruses y Betacoronaviruses ) y aves (por Gammacoronaviruses y Deltacoronaviruses ) . Estas especies reservorios aseguran la evolución y diseminación de coronavirus. En otras especies , los síntomas varían (enfermedades del tracto respiratorio superior en gallinas , diarrea en vacas o cerdos , tracto digestivo en perros y gatos , etc.). A veces, no hay síntomas asociados con su presencia (por ejemplo, coronavirus beluga ).

El ser humano alberga cuatro tipos de coronavirus naturalmente leves, que causan infecciones del tracto respiratorio , como el resfriado común , y rara vez afectan el sistema gastrointestinal , el corazón y el sistema nervioso .

Los grupos de coronavirus normalmente tienen un huésped animal específico ( mamíferos o aves) pero a veces pueden cambiar de huésped como resultado de una mutación . Son estas mutaciones las que probablemente han llevado a la aparición de cepas que causan infecciones graves en humanos ( SARS , MERS y Covid-19 ).

Tropismo

Durante mucho tiempo se pensó que los coronavirus tenían un tropismo únicamente respiratorio o gastrointestinal (expresado por neumonía y enterocolitis en casos graves), pero un número creciente de estudios muestra un tropismo mucho más amplio, particularmente cardiovascular y también neurológico (desde las primeras etapas). Se ha demostrado que varios coronavirus, de los cuales en el último caso el SARS-CoV-2 son claramente también neuroinvasores y neurotrópicos, hasta el punto de que esta diversidad de tropismos y síntomas hacen que los coronavirus (murinos en particular, agrupados bajo las siglas de MHV) un modelo animal para el estudio de enfermedades humanas tan variadas como esclerosis múltiple , hepatitis viral o neumonía (SR Weiss et al. 2011). El MHV ingresa al sistema nervioso central (SNC) a través de neuronas en el nervio olfatorio y puede causar encefalitis aguda o enfermedad desmielinizante crónica si persiste (también puede extenderse a la médula espinal ).

Investigar

En 2002, la aparición del Sars-CoV, virus responsable de una enfermedad infecciosa de los pulmones, llevó a la Unión Europea a poner en marcha varios programas para no ser pillada desprevenida ante nuevas emergencias. Desde 2004, el equipo de Bruno Canard, director de investigación del CNRS en Aix-Marseille, especialista en coronavirus, gracias a las redes colaborativas europeas, ha mostrado resultados prometedores. “Tuvimos esta idea que resultó fructífera: los virus tienen una enorme capacidad de ser diferentes, variados, con familias numerosas. Por lo tanto, los estudiamos todos al mismo tiempo, para tener un modelo estándar que nos permitiera, en caso de amenaza de un virus desconocido, encontrar uno cercano, del que extraer datos científicos. ".

Pero a partir de 2006, el interés de los políticos por el Sars-CoV desapareció. La crisis financiera de 2008 aceleró la retirada de Europa y Francia de la investigación, las estrategias de investigación fundamentales perdieron su financiación. Asimismo, en 2015, Bruno Canard, denuncia la desvinculación europea y francesa en el sector científico y envía con sus colegas belgas y holandeses cartas de intención a la Comisión Europea, donde explica que hay nueve familias de virus para los que es posible una emergencia. . “El primero de la lista fue el flavivirus ”, explica. El segundo, el coronavirus. Un año después apareció el Zika, un flavivirus ”. Sin embargo, la Comisión Europea nunca dará una respuesta. Y en 2020 aparece Sars-CoV-2, un coronavirus causante de Covid-19 .

Biología

Morfología

Este virus envuelto consiste en una envoltura viral que rodea una cápside helicoidal que contiene la hebra de ARN. El tamaño del genoma de estos virus varía de aproximadamente 26 a 32  kilobases , entre los valores más altos en los virus de ARN .

Los coronavirus tienen en común proteínas designadas por una letra que indica su ubicación: S (protuberancias), E (envoltura), M (membrana) y N (nucleocápside). Algunos, especialmente los del subgrupo A del género Betacoronavirus , tienen una proteína HE ( hemaglutinina esterasa  (en) ) característica. El coronavirus del SARS también presenta en la proteína S un sitio de unión específico para la enzima convertidora de angiotensina 2 que sirve como punto de entrada a la célula huésped .

El tamaño físico del virión se da convencionalmente como de 120 a 160  nm o como del orden de 125  nm . Sin embargo, el SARS-CoV-2 , responsable del Covid-19, ha sido anunciado más recientemente con una medida aproximada de 60 a 140  nm y con una forma elíptica con muchas variaciones.

Genoma

Todos los CoV tienen un genoma de ARN no segmentado (monocatenario) organizado de la misma manera: aproximadamente dos tercios del genoma contienen dos grandes   " marcos de lectura abiertos " superpuestos (conocidos como ORF1a y ORF1b ). Estos dos marcos se traducen en "  poliproteína replicasa" pp1a y pp1ab . “Estas poliproteínas luego se procesan para generar 16 proteínas no estructurales, denominadas nsp1 ~ 16. La parte restante del genoma contiene ORF para proteínas estructurales, incluida la punta (S), la envoltura (E), la membrana (M) y la nucleoproteína ( NORTE). Varias proteínas accesorias específicas de linaje también están codificadas por diferentes linajes CoV ” .

Replicación

Se realiza en seis pasos sucesivos (ver ilustración):

  1. gracias a su proteína S , los coronavirus se unen a moléculas de la superficie celular como las metaloproteinasas . Los virus con la adición de la proteína HE (hemaglutinina esterasa) en su envoltura también pueden unirse al ácido N-acetilneuramínico que sirve como correceptor (iniciador en sí mismo de la entrada de un patógeno en una célula huésped). No está claro si los virus ingresan a la célula huésped por fusión de las membranas viral y celular o por internalización del receptor . Cualquiera que sea el mecanismo, la hebra de ARN se inserta en la célula y la cápside (la cáscara) se abandona;
  2. Los coronavirus tienen un genoma de ARN de hebra única positiva, ahora en su lugar en el citoplasma . El genoma del ARN del coronavirus tiene un casquete metilado en 5 'y una cola poliadenilada en 3', lo que permite que el ARN se una a los ribosomas para su traducción. Los ribosomas de la célula decodifican el ARN viral, produciendo las proteínas codificadas en él;
  3. primero, el ARN positivo del virus se transcribe en proteína para formar su propia ARN polimerasa (una ARN polimerasa dependiente de ARN ). La replicasa es la primera proteína que se produce; Una vez que el ribosoma de la célula huésped ha traducido el gen que codifica la replicasa, un codón de parada detiene la traducción. Esta replicasa viral reconoce y produce solo ARN viral y permite que el genoma viral se transcriba en nuevas copias de ARN, utilizando la maquinaria de la célula huésped. Usando la hebra positiva como plantilla, esta enzima ensambla la hebra negativa;
  4. posteriormente, esta hebra negativa en sí misma sirve como plantilla para transcribir pequeños ARN subgenómicos, que se utilizan para fabricar todas las demás proteínas. Esto se llama transcripción anidada. Este proceso es una forma de economía genética que permite que el virus codifique la mayor cantidad de genes en una pequeña cantidad de nucleótidos;
    el ribosoma de la célula huésped traduce el genoma de la hebra negativa y se forma una poliproteína larga, donde se unen todas las proteínas virales. Los coronavirus tienen una proteína no estructural, una proteasa, que es capaz de escindir la poliproteína.
    Además, esta hebra negativa juega un papel en la replicación de nuevos genomas de ARN de hebra positiva.
    El citoplasma de la célula huésped se llena de proteínas virales y ARN;
  5. (a) la proteína N ayuda a unir el ARN genómico a la encapsidación del genoma viral en una envoltura protectora llamada cápside  ; la proteína M se integra en la membrana del retículo endoplásmico , en el lado de la cápside; y las proteínas HE y S atraviesan la membrana del retículo endoplásmico, a través de la proteína de translocación, y se colocan en el lado opuesto;
    (b) con la unión entre la cápside y las proteínas M, la membrana del retículo se invagina y brota. La cápside ensamblada (la cáscara) dotada de ARN helicoidal se encuentra entonces dentro del retículo endoplásmico, habiendo capturado para su beneficio la membrana de este último, que ahora lleva las proteínas HE y S en su exterior;
  6. esta progenie viral es luego (a) encapsulada y transportada por vesículas de Golgian a la membrana celular, (b) para ser finalmente exteriorizada (por exocitosis ) fuera de la célula.

Infección de coronavirus

Tipos de infeccion

Siete tipos de coronavirus infectan comúnmente a los humanos, tres de los cuales causan infecciones graves.

Infecciones leves

Los primeros cuatro tipos conocidos no son graves: los coronavirus humanos 229E , NL63 , OC43 y HKU1 , desconocidos en los murciélagos. Provocan resfriados con fiebre y dolor de garganta debido a la inflamación de las adenoides, principalmente en invierno y principios de primavera.

Se cree que los coronavirus son la causa del 15 al 30% de los resfriados comunes.

Infecciones graves.

Más recientemente se han descubierto tres tipos de coronavirus que no se encuentran naturalmente en los seres humanos, pero sí en los mamíferos, y que han causado infecciones graves de los pulmones ( neumonía viral):

Dependiendo del virus involucrado, las formas graves de la enfermedad tienen sus propias particularidades. Por ejemplo, la diarrea fue muy común en el SARS pero rara en la enfermedad por coronavirus 2019 .

Comparación de infecciones graves

Se utilizan tres fuentes principales: el Institut Pasteur , la OMS y los CDC de EE . UU .

Síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS) Síndrome respiratorio agudo severo (SARS) Enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19)
agente patógeno MERS-CoV SARS-CoV SARS-CoV-2
Año de aparición 2012 2003 2019
Numero de casos 1 219 8.098 de los cuales 5.327 en China. En progreso, ver aquí
Porcentaje de casos por transmisión nosocomial 70% 58%
Numero de muertes 449 774 (incluyendo 349 en China) En progreso, ver aquí
Tanque Camello Muerciélago Murciélago (probablemente)
Transmisión a humanos de animales Contacto directo con un animal infectado, consumo de leche cruda de camello . Consumo de carne de algalia de palma enmascarada , un animal salvaje que se vende en los mercados y se consume en el sur de China. Un pangolín podría ser el huésped intermedio.
Transmisión de persona a persona sí sí sí
Transmisión por objeto - sí Riesgo muy bajo.
Transmisión materno-fetal - No se encontró ningún caso en mujeres embarazadas infectadas por este virus. No hay pruebas.
Transmisión a través de la leche materna Un solo caso documentado RT-PCR negativo en 16 mujeres analizadas
Incubación Entre 5 y 15 días. Entre 2 y 7 días. El tiempo medio de incubación es de 5,1 días (promedio de 5,5 días), el 97,5% de las personas se enfermarán 11,5 días después del contacto infeccioso.
Portador saludable - Probablemente no. Sí (solo un caso publicado)
Contagio Tasa de reproducción inferior a 1. Tasa de reproducción superior a 2. Mediana de la tasa de reproducción inicial (R 0 ) en 2,79.
Duración del contagio - - Parece limitado al período de signos clínicos. Posibilidad controvertida de contagio en la fase asintomática.
Inicio del período contagioso - 3 a 4 días después de la aparición de los signos clínicos. Tan pronto como aparezcan los signos clínicos. Portador asintomático comprobado.
Fiebre Al 98% 99% Al 87,9%, pero puede aparecer varios días después de toser o dificultad para respirar.
Diarrea Al 26% Al 20%. Al 3,7%.
Transmisión a través de las heces Muy probablemente, pero jugó un papel menor. Se está considerando esta posibilidad.
Letalidad 34,4% 9,5%, más del 50% para los mayores de 65 años. 3,4%
Tratamiento Sintomático Sintomático Sintomático
Vacuna Ninguna Ninguna En curso
Estado Posible resurgimiento. Considerado erradicado. Epidemia en curso.

Cruzando la barrera del efectivo

En vista de las secuencias genómicas disponibles, dos taxones animales principales serían el principal reservorio de CoV:

  • Murciélagos  : huéspedes naturales de HCoV-NL63 y HCoV-229E;
  • roedores  : huéspedes naturales de HCoV-OC43 y HKU1.

A la vista del conocimiento disponible, los coronavirus parecían necesitar hospedadores intermedios (siempre mamíferos) para “humanizar”, es decir, mutar para poder infectar a los humanos.
Los hosts intermedios conocidos han sido:

Transmisión de persona a persona

Para la pandemia 2019-2020, consulte los artículos cuyos nombres siguen.

La transmisión de los coronavirus de persona a persona se produce principalmente a través de gotitas respiratorias o aerosoles expectorados por una persona infectada (al toser, estornudar, escupir o, a veces, simplemente hablando en voz alta o gritando ) cuando una persona cercana inhala las partículas virales. La transmisión y el contagio también varían según el coronavirus y quizás según su cepa dentro de una epidemia.

La profilaxis requiere una prevención primaria para limitar la transmisión del virus: evitar el contacto (superficies potencialmente contaminadas, apretones de manos, abrazos), lavarse las manos con frecuencia, evitar tocarse los ojos, la nariz o la boca, por donde el virus puede ingresar al cuerpo. En caso de síntomas como tos o resfriado, manténgase al menos a 1 metro de distancia de cualquier persona y evite emitir partículas contaminadas.

Otras recomendaciones incluyen:

  • no entre en contacto con animales obviamente enfermos, no coma carne de animales enfermos;
  • No consuma productos de origen animal mal cocidos (carne, etc.), ni verduras crudas si no han sido lavadas con agua no contaminada.

Tratamiento

En el caso del SARS, se utilizaron fármacos en un intento de detener la epidemia: ribavirina , un análogo de nucleótido, fármacos antiinflamatorios esteroides y, tras la identificación formal del patógeno y las pantallas de sensibilidad, los inhibidores de interferón alfa e inhibidores de proteasa . Su efectividad aún es cuestionable. Ninguno ha sido objeto de un estudio clínico adecuado: muchos estudios disponibles no permiten conclusiones científicas claras porque se llevaron a cabo en un número reducido de sujetos o sin protocolo o dosis fija. Algunos incluso señalan que estos tratamientos podrían haber afectado la erradicación del virus.

Bruno Canard denuncia en marzo 2020Runaway y publica una carta abierta Coronavirus: ¡la ciencia no funciona con prisa! . Él dice: “Una vacuna requiere 18 meses de investigación en el mejor de los casos. Y para virus impredecibles, que cambian, no es adecuado. Es mejor fabricar medicamentos que tengan un amplio espectro en una familia viral. Esto puede llevar 5 años, a veces 10. De ahí la importancia de la anticipación científica. ".

Vacunas

La rápida erradicación de la anterior epidemia de SARS no ha dejado mucho espacio para los ensayos clínicos. Desde hace varios años se están estudiando las vacunas basadas en virus inactivados y otras basadas en las proteínas S y N. Para las vacunas, los elementos virales que producen inmunidad a menudo no se conservan lo suficiente en la misma familia viral. "Entonces, si hubiera habido una vacuna contra el coronavirus de 2003, es prácticamente seguro que no habría funcionado satisfactoriamente contra [el] Covid-19" (Bruno Canard).

Taxonomía

Denominación de coronavirus

Los coronavirus son nombrados por un grupo de estudio que trabaja dentro del ICTV ( comité internacional de taxonomía de virus ).

Clasificación

Los coronavirus ( CoV ) son virus de ARN sola hebra de sentido positivo (grupo IV de la clasificación de Baltimore ) correspondiente a la subfamilia Orthocoronavirinae la taxonomía de ICTV , la familia Coronaviridae , y el orden Nidovirales .

Según las características de sus secuencias de proteínas, los CoV se clasifican en 4 géneros (alfa-CoV, beta-CoV, gamma-CoV y delta-CoV), todos los cuales contienen virus patógenos para mamíferos:

  1. Alfacoronavirus , que incluye elvirus de la diarrea epidémica porcina(PEDV), elvirus de la gastroenteritis transmisible porcina(TGEV), elsíndrome de diarrea aguda por coronavirus porcino(SADS-CoV), elcoronavirus canino, elcoronavirus entérico felino, elvirus de laperitonitis infecciosa felina(FIPV) ;
  2. Betacoronavirus , incluido el virus respiratorio-respiratorio delSARS(SARS-CoV), elSARS-CoV-2, el coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV), el virus de la hepatitis murina (MHV), el coronavirus bovino, el virus de la sialodacrioadenitis de rata, el virus de la sialodacrioadenitis porcina, porcino hemaglutinosis, coronavirus equino del virus de la hemaglutinosis porcina. En este género Betacoronavirus, elSARS-CoVy elSARS-CoV-2pertenecen al subgénero Sarbecovirus en el que se han identificado tres clados distintos:
    -Clade1: cepas "murciélago" de Bulgaria y Kenia;
    -Clade2:cepas deSARS-CoV-2 y "murciélago" del este de China;
    - Clade3:cepas deSARS-CoV y "murciélago" del suroeste de China:
  3. Gammacoronavirus : se encuentra principalmente en aves migratorias, causando bronquitis en particular; se aisló un gammacoronavirus de unabelugacautiva,
  4. Deltacoronavirus : conocido recientemente, que parece infectar principalmente a las aves, pero también se encuentra en los cerdos.

Notas  :

  • En ocasiones, un coronavirus se ha denominado según la especie animal donde se encontró por primera vez (por ejemplo: coronavirus respiratorio canino, o CRCoV para coronavirus respiratorio canino , virus perteneciente al género betacoronavirus y su subgrupo 2a).
  • El último coronavirus encontrado, en 2019 , es el SARS-CoV-2 , responsable de la pandemia Covid-19 .

Lista de especies

La subfamilia Orthocoronavirinae de la familia Coronaviridae está organizada en 4 géneros, 22 subgéneros y alrededor de cuarenta especies:


Notas

  1. Incluye casos de Puerto Rico y las Islas Vírgenes de EE . UU .
  2. Se incluyen casos identificados en Guadalupe , Guyana , Reunión , Martinica , Mayotte , Nueva Caledonia , Polinesia Francesa , Saint-Barthélemy , Saint-Martin y Saint-Pierre-et-Miquelon .
  3. Johns-Hopkins University agregando casos confirmados y probables, los datos de Public Health France se utilizan para Francia ( fuente ).
  4. Las cifras de enfrente no toman en cuenta el comunicado de la viceprimera ministra encargada de salud, Tatiana Golikova, quien indicó el 28 de diciembre que el COVID-19 habría matado a 186.000 desde el inicio de la pandemia. Ver "  Moscú admite que el número de muertos por Covid-19 en Rusia es tres veces el número oficial  " , en Le Monde ,29 de diciembre de 2020
  5. Incluye casos notificados en Anguila , las Bermudas a Gibraltar , las Islas del Canal , las Islas Caimán , las Islas Turquía y las Islas Caicos , las Islas Vírgenes Británicas en la Isla de Man y Montserrat .
  6. Se incluyen casos identificados en Aruba , Curazao y Saint-Martin .
  7. El número total de muertes registradas en10 de abrilse desglosan de la siguiente manera: 57  % ocurrió en un entorno hospitalario, 40  % en hogares de ancianos y ancianos (sin pruebas de confirmación), 1  % en el hogar del paciente y para el 2  % , la información no está disponible según Sciensano .
  8. Se incluyen los casos notificados en Groenlandia y las Islas Feroe .

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Ver también

Bibliografía

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Infografías

Artículos relacionados

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