Taxonomía
La taxonomía o taxonomía es una rama de las ciencias naturales (renombrado biología en el XX ° siglo), que tiene como objetivo describir la diversidad de los organismos vivos y agruparlos en entidades llamadas taxones para identificar (incluso a través de claves de identificación ), los describen , nombre ellos y los clasifican .
Constituye una subrama de la sistemática que tiene como objetivo, en primer lugar, enumerar y definir los vínculos de parentesco entre los diferentes organismos vivos y clasificarlos en categorías jerárquicas (por ejemplo, géneros, familias, órdenes). Estas dos disciplinas están tan estrechamente vinculadas que la diferencia entre taxonomía y sistemática no siempre es obvia.
La taxonomía moderna, evolutivo, basado en un enfoque fundamentalmente filogenético para la clasificación pero taxonomías análisis de la evidencia empírica se mantuvo a largo desconocidas para la ciencia antes de la llegada, durante la segunda mitad del XX ° siglo, los descubrimientos de la biología molecular .
Por extensión, el término taxonomía ahora se utiliza en otras ciencias, como las ciencias humanas y sociales , información ciencias o informática la ciencia .
La palabra taxonomía proviene del griego τάξις ( taxis ) “ubicación”, “clasificación”, “orden” y de νομός ( nomos ) que significa “ley”, “regla”). El término fue creado en 1813 , bajo la grafía de taxonomía , por el botánico suizo Augustin Pyrame de Candolle (1778-1841) en su Teoría elemental de la botánica o exposición de los principios de clasificación natural y el arte de describir y estudiar plantas. , para designar en su “teoría de las clasificaciones” tanto el método como lo que él llamó “bases de la botánica filosófica” ( Mémoires et souvenirs , Libro III, § 11). En la segunda edición publicada en 1819, consideró incorrecta la ortografía de la palabra taxonomía en su forma original, afirmando: “Sería más correcto decir Taxonomía; pero pensé que tenía que admitir la eliminación de la e , para acortar la palabra. " . Esto muestra que De Candolle en realidad derivó su término taxonomía , no del nominativo τάξις ( taxis ) sino de su genitivo τάξεως ( taxôs ).
El término taxonomía fue ratificado en 1836 en el Suplemento del Diccionario de la Academia Francesa .
La ortografía taxonómica se recomendó en 1864. Émile Littré , en su Diccionario de la lengua francesa (versión 1872-1877) especificó que la palabra taxonomía o taxionomía también podría usarse, formada en el griego etimón taxis (orden). El Grand Dictionnaire Terminologique , en Quebec , confirma que la taxonomía es recomendada por varios autores que consideran "taxonomía" como "un seguimiento de la taxonomía inglesa ", que sin embargo es históricamente falsa. De hecho, la taxonomía no apareció en inglés hasta 1819 bajo la influencia del francés, seis años después de que De Candolle la inventara. Sin embargo, los diccionarios franceses continúan difundiendo el error de que la grafía de la taxonomía (De Candolle, 1813) corresponde a la taxonomía inglesa . Por el contrario, la mayoría de los diccionarios de inglés afirman correctamente que la palabra taxonomía deriva del francés y, para TLFI , la taxonomía inglesa apareció solo en 1828 en el diccionario estadounidense de Webster .
El término taxonomía no deriva de la palabra taxón, siendo este último un concepto que apareció más tarde (palabra creada por el botánico Herman Johannes Lam en 1948 ). Así, la taxonomía no es, etimológicamente, el estudio de taxones sino las leyes del orden, por lo tanto las reglas de clasificación . Algunos especialistas hacen una diferencia en el uso, particularmente en botánica , entre la taxonomía que, formada en el griego etymon nómos (ley, regla), se refiere a cuestiones de clasificación, y la taxonomía que, formada en el griego etymon ónoma (nombre), se refiere a cuestiones de nomenclatura . Otros científicos usan el término taxionomía en su trabajo, particularmente en zoología , para nombrar grupos de seres vivos. Sin embargo, la palabra taxonomía también se usa muy a menudo para nombrar la ciencia de describir taxones. Incluso los autores que abogan por el uso del término “taxonomía” no hablan de “taxinas” sino de taxones, con la excepción, sin embargo, de un especialista en entomología que invoca la difusión del conocimiento francófona y deplora la influencia del inglés. Otros idiomas usan términos similares a "taxonomía", no a "taxonomía"; Así, escribimos Taxonomía en alemán, taxonomía en inglés, taxonomía en español (castellano), taxonomía en portugués y catalán, tassonomia en italiano, таксономия ( taksonomiya ) en ruso, etc.
En 1957, en Francia, la Academia de Ciencias adoptó el nombre "Taxonomía" para designar la ciencia de la clasificación.
El término se convirtió en una práctica común en la XXI ° siglo, ya sea en el guión original, taxonomía, aunque es desafiado etimológicamente o considera equivocado, o bajo la ortografía corregida por Émile Littré , la taxonomía con una "i", aunque que uno se refuta a sabiendas. La sustitución de la "o" por una "i" es percibida por algunos como purismo , que prefieren el término "taxonomía", al afirmar un uso mayoritario, coherencia y un "principio de prioridad".
La palabra “taxonomía” se utiliza en los apéndices del Código Internacional de Nomenclatura Zoológica bilingüe (publicado en francés e inglés ) en 1961 para la primera edición y en 1964 para la segunda edición.
El texto francés de la tercera edición del Code international de nomenclature zoologique (1985) menciona el término "taxonomía". En el glosario , “taxonomía” se define como “La teoría y práctica de clasificar organismos; parte de la sistemática, el estudio de las categorías de organismos y su diversidad ”.
El texto francés de la cuarta edición del Código Internacional de Nomenclatura Zoológica (1999) menciona los dos términos “taxonomía” y “taxonomía”. En el glosario, "taxonomía o taxonomía" se define como "Teoría y práctica de la clasificación de organismos".
En biología, la taxonomía es inseparable de la sistemática . Esta última, definida como el estudio de la diversidad y las relaciones evolutivas entre organismos vivos o fósiles, incluye naturalmente dos componentes complementarios que son la filogenética , es decir la disciplina interesada en la reconstrucción del ' árbol de la vida , y la taxonomía que produce clasificaciones formales. La forma en que la taxonomía debe tener en cuenta los resultados de la filogenética es también fuente de vivas controversias metodológicas y sobre todo filosóficas.
En la práctica, el término “sistemático” designa tanto el método utilizado (decimos por ejemplo el “sistema filogenético”) como el resultado obtenido con este método (el “sistema de Agaricales ”). En el sentido concreto del resultado, las dos ciencias no son muy distintas y a menudo se confunden, porque las practican simultáneamente las mismas personas. Los taxonomistas siempre han sido llamados sistemáticos, porque después de haber estudiado y descrito organismos, naturalmente intentaron clasificarlos del nivel bajo de especies ( taxonomía alfa o "taxonomía primaria").
Aquellos que utilizan principalmente el sentido de método (los filogenéticos en particular) a menudo nombran el resultado “clasificación”, o algunas veces “taxonomía” por abuso del lenguaje, especialmente en disciplinas no biológicas (ver Taxonomía (desambiguación) ).
La primera clasificación de las plantas se atribuye generalmente a Teofrasto al final de la IV º siglo BC. D. C. , aunque su Historia de las plantas toma en parte las teorías de la Escuela pitagórica . El primer clasificador conocido de animales fue Aristóteles , en el tratado Historia de los animales . El que tradicionalmente se presenta como el "padre de la ciencia", toma prestada la distinción de Demócrito al dividir a los animales en dos clases, los que tienen sangre y los que no la tienen (animales con sangre blanca o incolora a los que él llama linfa). Él subdivide a los animales de sangre roja en cinco clases (cuadrúpedos vivíparos, cetáceos, aves, cuadrúpedos ovíparos y peces) y animales de sangre blanca en cuatro (moluscos, testáceos , crustáceos e insectos).
El naturalista sueco Linneo ( 1707 - 1778 ) sentó las bases de la sistemática , y fue el autor de una clasificación cuyos principios principales fueron la base para la sistemática científica hasta mediados del XX ° siglo .
Aunque, como el método de Jussieu , utiliza nombres binomiales y defiende el “método natural” frente al “sistema artificial” de Carl von Linné , la taxonomía propuesta por de Candolle se aparta de él por la importancia que se le da a los cortes. Mientras que para Linné y Jussieu, la naturaleza “ no da un salto ”, Candolle insiste en las discontinuidades que están en la base de la noción de taxón , tanto entidad como corte .
En la sistemática clásica (a veces llamada "linnea"), el orden jerárquico interno de los taxones se basó originalmente en criterios de semejanza "morfológica" y supuestas afinidades. Aunque fuertemente antropocéntrica y reflejan las causas de la diversidad de los seres vivos ( la creación de Dios ) como pensamos los siguientes 250 años, todavía está en el comienzo del XXI ° siglo , que forma parte del patrimonio cultural común de todos los naturalistas. Pero posteriormente, a medida que avanzaba el conocimiento, en particular a partir de la obra de Jean-Baptiste de Lamarck y Charles Darwin , esta orden tuvo rápidamente la ambición de dar una imagen más de la evolución .
El antropocentrismo fue derrotado con Charles Darwin quien recomendó el 24 de noviembre de 1859 (en El origen de las especies ) una clasificación puramente genealógica . Si ha habido evolución, las especies deben clasificarse según su grado de relación evolutiva . Pero se necesitará casi un siglo para que la eliminación de los taxones polifiléticos se vuelva consensuada. Por otro lado, las interpretaciones divergentes del término "genealógico" en Darwin, como distancia patrística o bien como antigüedad relativa del último antepasado común , dieron lugar a dos corrientes intelectuales opuestas en taxonomía, respectivamente evolucionismo y cladismo .
En la segunda mitad del XX ° siglo , la llamada sistemática filogenética pasó de ser un método de reconstrucción que era una rotura violenta de desarrollo: el cladístico iniciado por Willi Hennig en 1950 . Este método se basa globalmente en relaciones evolutivas para las que el criterio fundamental para la elección de la clasificación es que debe reflejar estrictamente la filogenia, es decir los grados de parentesco entre especies. La misma noción de tal filogenia es una consecuencia de la teoría de la evolución , y el éxito predictivo de los árboles filogenéticos es una de las pruebas de esta teoría.
Los avances importantes en genómica han sido posibles gracias al análisis genético automático y al desarrollo de herramientas y modelos informáticos. Imponen y permiten la redefinición de determinadas especies o grupos de especies y permitirían un mejor conocimiento y seguimiento de las especies.
Todas las clasificaciones actuales tienen la forma de árbol (clasificación arborescente), desde una raíz que incluye a todos los seres vivos que existen o han existido, hasta los individuos . Cada nodo del árbol define un taxón , que agrupa todos los sub-taxones que genera el nodo.
Un concepto de clasificación importante y bastante estable es el de especie . Esta agrupación está relativamente bien definida, al menos para las especies reproductoras .
La especie se define como una comunidad de seres vivos interfértiles (o interfértiles , capaces de reproducirse entre sí), capaces de intercambiar material genético y producir descendientes ellos mismos fértiles (de hecho, algunos individuos del mismo género pero pertenecientes a diferentes especies pueden cruzar a dar un individuo híbrido , pero este suele ser estéril). En el caso de la multiplicación estrictamente asexual , hablamos incorrectamente de especie en lugar de linaje , siendo el grupo entonces puramente filogenético. El caso de las entidades limítrofes con los vivos ( virus , priones ) sigue siendo diferente; generalmente están excluidos de las clasificaciones. Otra dificultad a citar es la de las simbiosis estrictas, como los líquenes (que combinan un organismo de naturaleza fúngica y un organismo capaz de fotosíntesis, de naturaleza vegetal), pero en general, uno de los dos socios es capaz de vivir sin asociarse con la otra, y podemos clasificarlos en dos especies distintas, con la característica de una de las dos especies de no poder sobrevivir sin la otra.
La descripción de una nueva especie la realiza un taxónomo basándose en los conocimientos actuales, sobre la base de los datos y las herramientas de análisis disponibles. Esta descripción puede ser cuestionada por otro especialista que no comparta la misma concepción, o por el descubrimiento de nuevos métodos de análisis.
Las especies se nombran según el sistema binominal utilizado por primera vez por Guillaume Rondelet y Pierre Belon en el XVI ° siglo y generalizada por Carlos Linneo en el XVIII ° siglo . El nombre científico de una especie es la combinación de dos palabras latinas o consideradas latinas (hasta tres en algunas disciplinas, para una subespecie, variedad o forma) generalmente escrito en cursiva : un nombre del género, seguido de uno o dos epítetos específicos.
Por debajo del rango de género, todos los nombres de taxones se denominan combinaciones. Hay varias categorías de combinaciones:
El enfoque filogenético actual utiliza datos de cladística , pero sus requisitos se limitan a aceptar solo taxones monofiléticos , es decir, correspondientes a un determinado clado . Solicita que los taxones se limiten a aquellos que cumplan las dos condiciones siguientes:
Entonces hablamos solo de un taxón monofilético o clado. Esta restricción ha provocado cambios fundamentales en la clasificación científica, algunos de ellos anulando el "sentido común" moldeado por la herencia cultural. Por lo tanto, los dinosaurios no han desaparecido , la sistemática moderna incluye a las aves en el grupo "dinosaurios".
Entre otros ejemplos, taxones tradicionales como reptiles , peces , algas , dicotiledóneas , pónidos , no son elegibles para la sistemática filogenética, porque se consideran polifiléticos (múltiples orígenes) o parafiléticos (incompletos) (las dicotiledóneas han sido reemplazadas por dicotiledóneas verdaderas ). Otros sobrevivieron con algunas secuelas, como hongos . Finalmente, algunos han capeado la tormenta, como animales ( metazoos ) o mamíferos . Tenga en cuenta que no era obvio que todos los animales multicelulares compartan un ancestro común que los separe de cualquier planta u hongo.
Aparte de eso, su estructura sigue siendo fundamentalmente Linnaean y su nomenclatura (es decir, los nombres mismos) también.
Existen varios enfoques técnicos para la construcción de árboles filogenéticos.
Según las publicaciones, hasta el día de hoy encontramos clasificaciones de todo tipo, desde la clasificación tradicional, que acaba de ser revisada, hasta clasificaciones estrictamente cladistas sin rangos taxonómicos, pasando por diferentes mezclas, por ejemplo manteniendo los rangos taxonómicos pero alineándose con los clados , o métodos de tratamiento posfilogenéticos que resaltan automáticamente los grados en evolución .
Las prácticas de la disciplina están evolucionando hacia una ciencia integradora articulando la colección de ejemplares en campo, en diversas partes del mundo, con un trabajo de descripción en el laboratorio , asociando los enfoques tradicionales ( morfología , ecología , etc. ), y los métodos moleculares más recientes ( código de barras molecular ).
Los avances en genética y bioinformática también permiten avanzar en la taxonomía, lo que también resulta en frecuentes revisiones y actualizaciones, que a veces se llevan a cabo en modos alternativos, más cooperativos y reactivos de publicación científica.
De plus, l'étude de la biodiversité bactérienne , ou des espèces microbiennes du sol ou des océans , est complexe et nécessite - outre de nouveaux moyens en métagénomique ( barcoding de l'ADN microbien ) - une collaboration entre de nombreux spécialistes répartis dans le mundo entero.
Los naturalistas han desarrollado herramientas para el trabajo colaborativo y el intercambio con, por ejemplo, Tela botánica (para botánicos ) y más recientemente el European Journal of Taxonomy (EJT). Es una revista científica internacional de taxonomía descriptiva, apoyada por un Consorcio WCY (de museos de historia natural y jardines botánicos ), publicada en inglés, en formato electrónico, bajo licencia Open Access , bajo licencia Creative Commons (3.0), es decir, open acceso, publicación gratuita y consulta gratuita. Se ocupa de los campos de la zoología , entomología , botánica y paleontología . Los artículos son trabajos originales, debiendo cumplir criterios de alta calidad en cuanto a contenido científico y forma (estilo, ilustraciones, etc.). La revista es europea, pero los temas pueden relacionarse con todas las especies, independientemente de su país de origen. De esta forma, las revisiones taxonómicas, las monografías y los artículos temáticos o de opinión se pueden compartir mejor y más rápidamente.
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