Isocitrato deshidrogenasa

IDH citosólico
Dímero citosólico de isocitrato deshidrogenasa humana con NADP en verde, isocitrato en cian y Ca 2+ en naranja ( PDB  1T0L )
Principales características
Símbolo	IDH1
EC No.	1.1.1.42
Homo sapiens
Lugar	2 q 34
Peso molecular	46 659  Da
Número de residuos	414  aminoácidos
Enlaces accesibles desde GeneCards y HUGO .
Adelante 3417 HUGO 5382 OMIM 147700 UniProt O75874 RefSeq ( ARNm ) NM_001282386.1 , NM_001282387.1 , NM_005896.3 RefSeq ( proteína ) NP_001269315.1 , NP_001269316.1 , NP_005887.2 Juntos ENSG00000138413 PDB 1T09 , 1T0L , 3INM , 3MAP , 3MAR , 3MAS , 4I3K , 4I3L , 4KZO , 4L03 , 4L04 , 4L06 , 4UMX , 4UMY , 4XRX , 5DE1 GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega
IDH mitocondrial en NADP +
Principales características
Símbolo	IDH2
EC No.	1.1.1.42
Homo sapiens
Lugar	15 q 26,1
Peso molecular	50 909  Da
Número de residuos	452  aminoácidos
Enlaces accesibles desde GeneCards y HUGO .
Adelante 3418 HUGO 5383 OMIM 147650 UniProt P48735 RefSeq ( ARNm ) NM_001289910.1 , NM_001290114.1 , NM_002168.3 RefSeq ( proteína ) NP_001276839.1 , NP_001277043.1 , NP_002159.2 Juntos ENSG00000182054 PDB 4JA8 GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega
IDH mitocondrial en NAD +
Principales características
Símbolo	IDH3
EC No.	1.1.1.41
Gen IDH3A - cadenas α
Homo sapiens
Lugar	15 q 25,1
Peso molecular	39 592  Da
Número de residuos	366  aminoácidos
Enlaces accesibles desde GeneCards y HUGO .
Adelante 3419 HUGO 5384 OMIM 601149 UniProt P50213 RefSeq ( ARNm ) NM_005530.2 RefSeq ( proteína ) NP_005521.1 Juntos ENSG00000166411 GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega
Gen IDH3B - cadena β
Homo sapiens
Lugar	20 p. 13
Peso molecular	42 184  Da
Número de residuos	385  aminoácidos
Enlaces accesibles desde GeneCards y HUGO .
Adelante 3420 HUGO 5385 OMIM 604526 UniProt O43837 RefSeq ( ARNm ) NM_006899.4 , NM_174855.3 RefSeq ( proteína ) NP_008830.2 , NP_777280.1 Juntos ENSG00000101365 GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega
Gen IDH3G - cadena γ
Homo sapiens
Lugar	X q 28
Peso molecular	42 794  Da
Número de residuos	393  aminoácidos
Enlaces accesibles desde GeneCards y HUGO .
Adelante 3421 HUGO 5386 OMIM 300089 UniProt P51553 RefSeq ( ARNm ) NM_004135.3 , NM_174869.2 RefSeq ( proteína ) NP_004126.1 , NP_777358.1 Juntos ENSG00000067829 GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega

La isocitrato deshidrogenasa ( IDH ) es una oxidorreductasa que cataliza la reacción  :

isocitrato + NADP + / NAD +   α-cetoglutarato + CO 2⇌{\ Displaystyle \ rightleftharpoons}  + NADPH / NADH + H + .

Esta reacción global tiene lugar en dos etapas:

• isocitrato + NADP + / NAD +   oxalosuccinato + NADPH / NADH + H +  ;⇌{\ Displaystyle \ rightleftharpoons} 
• oxalosuccinato  α-cetoglutarato + CO 2⇌{\ Displaystyle \ rightleftharpoons}  .

En los seres humanos , esta enzima existe en tres isoformas llamadas IDH1 , IDH2 e IDH3. La isoenzima IDH3 está presente en la mitocondria donde interviene para 4 º y 5 º  los pasos del ciclo de Krebs para catalizar la descarboxilación de isocitrato en α-cetoglutarato en la reducción de la NAD + en NADH  ; los otros dos están presentes en el citosol , peroxisomas y mitocondrias, donde catalizan la misma reacción que IDH3, posiblemente independientemente del ciclo de Krebs, y reducen NADP + a NADPH en lugar de usar NAD + como coenzima

Estas tres isoformas humanas de isocitrato deshidrogenasa tienen las siguientes características:

• IDH1 se expresa en gran medida en el hígado y se presenta como un homodímero . Esta enzima está involucrada en el ciclo de Krebs pero también en la defensa contra el estrés oxidativo debido a los derivados reactivos del oxígeno . Es dependiente de NADP + .

• IDH2 se expresa en gran medida en el corazón , los músculos y los linfocitos activados, y se presenta como un homodímero . También es dependiente de NADP + .

• IDH3 es una enzima mitocondrial que se presenta como un heterotetrámero α 2 βγ. A diferencia de los dos anteriores, depende de NAD + .

Isocitrato deshidrogenasa (NADP + ) Representación de una isocitrato deshidrogenasa de E. coli complejada con el isocitrato de magnesio y NADP + ( PDB  1AI3 ) Llave de datos

EC No.	EC 1.1.1.42
número CAS	9028-48-2
Cofactor (es)	Mn o Mg

Actividad enzimática

IUBMB	Entrada IUBMB
IntEnz	Vista IntEnz
BRENDA	Entrada BRENDA
KEGG	Entrada KEGG
MetaCyc	Camino metabólico
PRIAM	Perfil
PDB	Estructuras
IR	AmiGO / EGO

Isocitrato deshidrogenasa (NAD + ) Llave de datos

EC No.	EC 1.1.1.41
número CAS	9001-58-5
Cofactor (es)	Mn o Mg

Actividad enzimática

IUBMB	Entrada IUBMB
IntEnz	Vista IntEnz
BRENDA	Entrada BRENDA
KEGG	Entrada KEGG
MetaCyc	Camino metabólico
PRIAM	Perfil
PDB	Estructuras
IR	AmiGO / EGO

IDH monomérico Isocitrato deshidrogenasa monomérica de Azotobacter vinelandii  (en) ( PDB  1ITW ) Dominio proteico

Pfam	PF03971
Clan Pfam	CL0270
InterPro	IPR004436
SCOP	1ofg
SUPERFAMILIA	1ofg

Objetivo terapéutico

Se han detectado mutaciones de HDI en cánceres que conducen a disfunciones del metabolismo celular que pueden participar en el crecimiento de las células tumorales. Por tanto, se han desarrollado inhibidores de HDI:

• enasidenib  : inhibidor de HDI 2
• ivosidenib  : inhibidor de HDI 1
• vorasidenib  : inhibidor de IDH1 y 2

Notas y referencias

1. (in) Xiang Xu Jingyue Zhao, Zhen Xu Baozhen Peng Qiuhua Huang, Eddy Arnold y Jianping Ding , "Las  estructuras de la isocitrato deshidrogenasa citosólica dependiente de NADP humano revelan un nuevo mecanismo de actividad autorregulador  " , Journal of Biological Chemistry , vol.  279, n o  32, 6 de agosto de 2004, p.  33946-33957 ( PMID  15173171 , DOI  10.1074 / jbc.M404298200 , leer en línea )
2. Los valores para la masa y el número de residuos indicados aquí son los del precursor de la proteína resultante de la traducción del gen , antes de las modificaciones postraduccionales , y pueden diferir significativamente a partir de los valores correspondientes para la proteína funcional.
3. (en) Daniel Krell, Mawuelikem Assoku Malcolm Galloway, Paul Mulholland, Ian Tomlinson y Chiara Bardella , "  pantalla para IDH1 , IDH2 , IDH3 , D2HGDH y L2HGDH mutaciones en Glioblastoma  " , PLoS One , vol.  6, n o  5, Mayo de 2011, e19868 ( PMID  21625441 , PMCID  3100313 , DOI  10.1371 / journal.pone.0019868 , Bibcode  2011PLoSO ... 619868K , leer en línea )
4. (En) Andrew D. Mesecar, Barry L. Stoddard y Daniel E. Koshland Jr. , "  Dirección orbital en el poder catalítico de las enzimas: pequeños cambios estructurales con grandes consecuencias catalíticas  " , Science , vol.  277, n o  5323, 11 de julio de 1997, p.  202-206 ( PMID  9211842 , DOI  10.1126 / science.277.5323.202 , leer en línea )