Pioverdina

Pioverdina
Pyoverdine.svg
Ejemplo de la estructura de una pioverdina.
Identificación
Sinónimos

pseudobactina

N o CAS 8062-00-8
PubChem 45479427 (Pioverdina tipo I )
Sonrisas CC (C1C (= O) NC (C (= O) NCCCCC (C (= O) NC (C (= O) N1) CCCN (C = O) O) NC (= O) C (CCCN (C = O) )) O) NC (= O) C (CO) NC (= O) C (CCCN = C (N) N) NC (= O) C (CO) NC (= O) [C @@ H] 2CCNC3N2C4 = CC (= C (C = C4C = C3NC (= O) CCC (C (= O) O) N) O) O) C (C) O) O
PubChem , vista 3D
InChI Std. InChI: Vista 3D
InChI = 1S / C56H88N18O22 / c1-27 (79) 43-53 (91) 61-15-4-3-8-31 (46 (84) 65-34 (11-7-19-73 ( 96) 26-78) 49 (87) 70-44 (28 (2) 80) 54 (92) 71-43) 64-47 (85) 33 (10-6-18-72 (95) 25-77) 67-50 (88) 36 (23-75) 68-48 (86) 32 (9-5-16-62-56 (58) 59) 66-51 (89) 37 (24-76) 69-52 ( 90) 38-14-17-60-45-35 (63-42 (83) 13-12-30 (57) 55 (93) 94) 20-29-21-40 (81) 41 (82) 22- 39 (29) 74 (38) 45 / h 20-22.25-28.30-34.36-38.43-45.60.75-76.79-82.95-96H, 3-19.23-24.57H2.1-2H3, (H, 61.91) (H, 63,83) (H, 64,85) (H, 65,84) (H, 66,89) (H, 67,88) (H, 68,86) (H, 69,90) (H, 70,87) (H, 71,92) (H, 93,94) (H4. 58.59.62) / t27 ?, 28 ?, 30 ?, 31 ?, 32 ?, 33 ?, 34 ?, 36 ?, 37 ?, 38-, 43 ?, 44 ?, 45 ?, / M0 / s1
Est. InChIKey:
QIRRYPHVUMPBDX-UARRTFJPSA-N
Propiedades químicas
Fórmula bruta C 56 H 88 N 18 O 22   [Isómeros]
(Fórmula de pioverdina tipo I )
Masa molar 1365.4053 ± 0.0612  g / mol
C 49.26%, H 6.5%, N 18.46%, O 25.78%,
Unidades de SI y STP a menos que se indique lo contrario.

Una pioverdina es un antibiótico sideróforo fluorescente y oligopéptido producido en particular por Pseudomonas aeruginosa y Pseudomonas fluorescens , de bacterias a Gram-negativas . Actualmente se conocen alrededor de sesenta moléculas relacionadas. Las pioverdinas actúan como factores de virulencia para Pseudomonas .

Naturaleza bioquímica de las pioverdinas.

A diferencia de la enterobactina , las pioverdinas son péptidos no ribosomales que contienen un derivado de la dihidroxiquinolina. La estructura del péptido difiere según la especie y se han descrito alrededor de cuarenta estructuras diferentes, mientras que el cromóforo ácido (1 S ) -5-amino-2,3-dihidro-8,9-dihidroxi-1H-pirimido [1, El 2- a ] quinolin-1-carboxílico permanece sin cambios excepto por la azobactina de Azotobacter vinelandii  (en) que tiene un anillo de urea adicional.

Ejemplos de

Pioverdina péptido estructura de varios fluorescentes de Pseudomonas cepas
Dinero en efectivo Son Cadena peptídica de pioverdina *
P. aeruginosa ATCC15692 Q- D Ser-Arg- D Ser-FoOHOrn-c (Lys-FoOHOrn-Thr-Thr)
P. aeruginosa ATCC27853 Q- D Ser-FoOH D Orn-Orn-Gly-a D Thr-Ser-cOHOrn
P. aeruginosa Pa6 Q- D Ser-Dab-FoOHOrn-Gln- D Gln-FoOH D Orn-Gly
P. chlororaphis ATCC9446 Q- D Ser-Lys-Gly-FoOHOrn-c (Lys-FoOH D Orn-Ser)
P. fluorescens bv.I ATCC13525 Q- D Ser-Lys-Gly-FoOHOrn-c (Lys-FoOH D Orn-Ser)
P. fluorescens bv.I 9AW Q- D Ser-Lys-OHHis-a D Thr-Ser-COHOrn
P. fluorescens bv.III ATCC17400 Q- D Ala- D Lys-Gly-Gly-OHAsp- D Gln / Dab-Ser- D Ala-cOHOrn
P. fluorescens bv.V 51W Q- D Ala- D Lys-Gly-Gly-OH D Asp- D Gln- D Ser-Ala-Gly-a D Thr-COHOrn
P. fluorescens bv.V 1W Q- D Ser-Lys-Gly-FoOHOrn-c (Lys-FoOH D Orn-Ser)
P. fluorescens bv.V 10CW Q- D Ser-Lys-Gly-FoOHOrn-c (Lys-FoOH D Orn-Ser)
P. fluorescens bv.VI PL7 Q- D Ser-AcOH D Orn-Ala-Gly-a D Thr-Ala-cOHOrn
P. fluorescens bv.VI PL8 Q- D Lys-AcOH D Orn-Ala-Gly-a D Thr-Ser-cOHOrn
P. fluorescens 1.3 Q- D Ala- D Lys-Gly-Gly-OHAsp- D Gln / Dab-Gly-Ser-cOHOrn
P. fluorescens 18,1 Q- D Ser-Lys-Gly-FoOHOrn-Ser- D Ser-Gly-c (Lys-FoOH D Orn-Ser)
P. fluorescens CCM 2798 Q-Ser-Dab-Gly-Ser-OH D Asp-Ala-Gly- D Ala-Gly-cOHOrn
P. fluorescens CFBP 2392 Q- D Lys-AcOH D Orn-Gly-a D Thr-Thr-Gln-Gly- D Ser-cOHOrn
P. fluorescens CHA0 Q-Asp-FoOH D Orn-Lys-c (Thr-Ala-Ala-FoOH D Orn-Lys)
P. putida bv. B 9BW Q- D Ser-Lys-OHHis-a D Thr-Ser-COHOrn
P. putida CFBP 2461 Q-Asp-Lys-OH D Asp-Ser-a D Thr-Ala-Thr- D Lys-COHOrn
P. tolaasii NCPPB 2192 Q- D Ser-Lys-Ser- D Ser-Thr-Ser-AcOHOrn-Thr- D Ser-cOH D Orn
* Los aminoácidos se abrevian en tres letras. También se utilizan las siguientes abreviaturas: Q = cromóforo , D Xxx = D amino ácido , ATHR = alo-treonina , un D Thr = alo- D -treonina , c = estructura de anillo , Cohorn = ciclo-hydroxyornithine , Dab = ácido diaminobutírico , Ac = acetilo , Fo = formilo , OH = hidroxilo .

Usos

Estas pioverdinas pueden impulsar ciertos procesos de fitorremediación , para el hierro, pero también para otros metales (los sideróforos son particularmente efectivos para capturar hierro, pero también muestran una buena afinidad por 28 metales divalentes, incluidos Cd (II) y Ni (II).

Notas y referencias

  1. Pioverdinas de Pseudomonas fluorescens , Sigma-Aldrich
  2. masa molecular calculada de pesos atómicos de los elementos 2007  " en www.chem.qmul.ac.uk .
  3. (en) S. Wendenbauma P. Demangea, A. Dellb, JM Meyerc Abdallaha y MA , La estructura de pyoverdine Pa, el sideróforo de Pseudomonas aeruginosa  " , Tetrahedron Letters , vol.  24, n o  44, 1983, p.  4877-4880 ( leer en línea ) DOI : 10.1016 / S0040-4039 (00) 94031-0
  4. (in) Isabelle J. Schalk y Laurent Guillon , Biosíntesis y secreción de pioverdina en Pseudomonas aeruginosa: Implicaciones para la homeostasis de metales  " , Microbiología ambiental , vol.  15, n o  6, Junio ​​del 2013, p.  1661-1673 ( leer en línea ) DOI : 10.1111 / 1462-2920.12013 PMID 23126435
  5. (in) Pol Nadal Jimenez, Gudrun Koch, Jessica A. Thompson, Karina B. Xavier Robbert H. Cool J. y Wim Quax , Los sistemas de señalización múltiple que regulan la virulencia en Pseudomonas aeruginosa  " , Revisiones de microbiología y biología molecular , vuelo.  76, n o  1, marzo 2012, p.  46-65 ( leer en línea ) DOI : 10.1128 / MMBR.05007-11 PMID 22390972
  6. (en) Jean-Marie Meyer , “  Pyoverdines: pigmentos, sideróforos y posibles marcadores taxonómicos de fluorescentes de Pseudomonas especies  ” , Archivos de Microbiología , vol.  174, n o  3, Septiembre de 2000, p.  135-142 ( leer en línea ) DOI : 10.1007 / s002030000188 PMID 11041343
  7. Hurón, C. (2012). Papel de las Pseudomonas fluorescentes en la biodisponibilidad de metales que contaminan los minerales del suelo: aplicación a la fitorremediación (Tesis doctoral, Universidad de Estrasburgo)
  8. FERRET, C. (2012). Papel de las Pseudomonas fluorescentes en la biodisponibilidad de metales que contaminan los minerales del suelo (aplicación a la fitorremediación) ( resumen ).
  9. Cornu, JY, Elhabiri, M., Ferret, C., Jezequel, K., Leva, Y., Lollier, M., ... y Lebeau, T. (2014). Bioaumentación asistida por fitoextracción de suelos contaminados por Cu y Cd: papel de la pioverdina sideróforo bacteriano. 한국 토양 비료 학회 학술 발표회 초록집, 527-527.
  10. Ferret, C., Cornu, JY, Elhabiri, M., Sterckeman, T., Braud, A., Jezequel, K., ... & Geoffroy, V. de suministro de pioverdina sobre la complejación de cadmio y níquel y la fitodisponibilidad en hidroponía (Borrador del manuscrito, con respuesta a los revisores)

Ver también

bibliografía