Treonina proteasa

Una treonina proteasa es una peptidasa cuyo residuo del aminoácido nucleófilo en la tríada catalítica es una treonina . Las subunidades catalíticas del proteasoma son el prototipo de esta familia de enzimas , pero las aciltransferasas han experimentado una convergencia evolutiva hacia el mismo tipo de geometría y mecanismo de reacción de su sitio activo .

Las treonina proteasas utilizan el alcohol secundario de su N - treonina terminal como residuo nucleofílico requerido para la catálisis . Este residuo debe ser N -terminal porque el terminal amida actúa como base polarizando una molécula de agua que desprotoniza el alcohol secundario y aumenta su reactividad como nucleófilo.

La catálisis ocurre en dos etapas:

  1. el residuo nucleofílico ataca al sustrato para formar un intermedio covalente de acil-enzima , que libera el primer producto;
  2. el intermedio se hidroliza para liberar el segundo producto y regenerar la enzima libre.

Este tipo de mecanismo de reacción es común a las enzimas cuyo sitio activo utiliza una tríada catalítica .

Notas y referencias

  1. (en) Masaki Unno, Tsunehiro Mizushima Yukio Morimoto, Yoshikazu Tomisugi, Keiji Tanaka, Noritake Yasuoka y Tomitake Tsukihara , La estructura del proteasoma de mamíferos 20S con una resolución de 2,75 Å  " , Estructura , vol.  10, n o  5, Mayo de 2002, p.  609-618 ( PMID  12015144 , DOI  10.1016 / S0969-2126 (02) 00748-7 , leer en línea )
  2. (en) James A. Brannigan, Guy Dodson, Helen J. Duggle por Peter CE Moody, Janet L. Smith, Diana R. Tomchick y Alexey G. Murzin , Una proteína catalítica marco con un nucleófilo N-terminal es capaz de -activación  ” , Nature , vol.  378, n o  6555, 23 de noviembre de 1995, p.  416-419 ( PMID  7477383 , DOI  10.1038 / 378416a0 , leer en línea )
  3. (en) Hua Cheng y Nick V. Grishin , DOM-fold: Una estructura con bucles cruzados que se encuentran en DMPA, ornitina acetiltransferasa y dominio de unión al cofactor de molibdeno  " , Protein Science , vol.  14, n o  7, Julio de 2005, p.  1902-1910 ( PMID  15937278 , DOI  10.1110 / ps.051364905 , leer en línea )
  4. (en) Guy Dodson y Alexander Wlodawer , Tríadas catalíticas y su relación  " , Tendencias en ciencias bioquímicas , vol.  23, n o  9, Septiembre de 1998, p.  347-352 ( PMID  9787641 , DOI  10.1016 / S0968-0004 (98) 01254-7 , leer en línea )
  5. (en) Özlem Doğan Ekici, Mark Paetzel y Ross E. Dalbey , Serina proteasas no convencionales: variaciones en la configuración catalítica de la tríada Ser / His / Asp  " , Protein Science , vol.  17, n o  12, diciembre de 2008, p.  2023-2037 ( PMID  18824507 , DOI  10.1110 / ps.035436.108 , leer en línea )