Eco RI (Eco "R" un) es una enzima de restricción producida por la cepa bacteriana Escherichia coli , una bacteria comensal del sistema digestivo humano . Su sitio de reconocimiento es el siguiente:
5'-GAATTC-3' 3'-CTTAAG-5'La mayoría de las veces, los sitios de restricción son palindrómicos , es decir, la secuencia de ADN es la misma cuando se lee desde la dirección 5 'a 3'.
Es una endonucleasa de restricción de tipo II, que es muy común en las bacterias.
EcoRI se mueve deslizándose a lo largo de la columna vertebral de fosfato-azúcar del ADN. EcoRI se puede unir al ADN de 2 formas: de forma específica a su sitio de reconocimiento, inmóvil, lo que lleva a la escisión del ADN, y de forma más flexible e inespecífica, permitiendo su desplazamiento. Estas 2 formas se aplican de forma alterna y continua.
El corte en el ADN se desplazará en cada hebra en unos pocos nucleótidos. Se dice que el corte genera extremos cohesivos (a diferencia de los extremos romos donde no hay desplazamiento en el corte, obtenido por EcoRV, otra enzima de restricción).