Un sitio AP ( sitio apurínico / apirimídico), o sitio abásico , es una ubicación en el ADN donde falta la base ( purina o pirimidina ). En términos de secuencia genética, es, por tanto, un sitio "vacante".
Los sitios AP aparecen espontáneamente por depurinación o, más raramente, por despirimidinación ( hidrólisis ). Esta reacción ocurre con frecuencia en condiciones fisiológicas y representa una amenaza para la integridad del genoma: en los mamíferos , por ejemplo, la formación espontánea de sitios abásicos ocurre a una velocidad de aproximadamente 10,000 por día por célula. En cada celda, hay permanentemente entre 50.000 y 200.000, esta tasa varía de un tejido a otro.
Sitios de AP también constituyen la primera etapa de la reparación por escisión de base (BER base de reparación de escisión ) de ADN. En este proceso, una enzima especializada (una ADN glicosilasa ) identifica un tipo dado de base dañada y escinde el enlace N- glicosídico para escindir la base: el sitio abásico así creado es luego reparado por otras enzimas para reconstituir la secuencia genética original.
Normalmente, los sitios abásicos aislados se reparan mediante la acción sucesiva de las enzimas del sistema BER (principalmente endonucleasa AP , ADN polimerasa β , luego ADN ligasa ).
Los sitios AP también pueden aparecer después de la irradiación . En este caso, a menudo observamos "clusters", es decir, varios sitios AP ubicados uno al lado del otro. Estos grupos son muy difíciles de reparar y pueden persistir durante varios días.
En ausencia de reparación, los sitios AP evolucionan en unos pocos días hacia una ruptura de una sola hebra en el ADN (efecto clastogénico ).
Los sitios AP también tienen un efecto mutagénico muy fuerte : en el momento de la replicación, las ADN polimerasas no tienen forma de determinar qué base colocar frente a estos sitios vacantes y "elegirán" arbitrariamente. Muy a menudo, las polimerasas insertarán preferentemente una adenina (la "regla de A"), de modo que el sitio abásico será reemplazado por una timina .
Por último, parece que un sitio AP puede, en determinadas condiciones, generar un puente covalente entre cadenas (en inglés, (en) reticulación entre cadenas de ADN ), que podría conducir a la muerte de la célula (efecto citotóxico ).