Los proyectos de secuenciación del genoma son proyectos científicos que tienen como objetivo obtener las secuencias completas de los genomas de varios organismos: bacterias , plantas , hongos , animales y humanos.
Este trabajo requiere la secuencia de ADN de cada uno de los cromosomas de las especies. Para una bacteria, solo hay un cromosoma para secuenciar. Para la especie humana, que tiene 22 pares de cromosomas y 2 cromosomas sexuales (X e Y), hay 24 cromosomas para secuenciar.
El proyecto del genoma humano se ha completado desde 2003.
El ensamblaje genómico implica tomar una gran cantidad de secuencias de ADN, que se obtuvieron mediante el método Whole Genome Shotgun , para volver a unirlas y recrear el cromosoma original. En el método Whole Genome Shotgun , el ADN de un solo organismo se divide en millones de partes. Estos son leídos por secuenciadores automáticos de ADN (que pueden determinar 900 bases por minuto). Las cuatro bases son adenina , guanina , citosina y timina , abreviado AGCT. El software de algoritmo de ensamblaje genómico analiza cada fragmento y los alinea uno detrás del otro, detectando áreas de superposición entre los fragmentos. Si dos secuencias coinciden, se consideran idénticas, lo que conecta los fragmentos.
El ensamblaje genómico puede ser problemático para los informáticos, porque los genomas contienen secuencias repetidas y estas repeticiones pueden tener varios miles de nucleótidos (o bases) de longitud y en varios lugares del genoma. Este es especialmente el caso de los grandes genomas de plantas y animales .
Muchos organismos son objeto de proyectos de secuenciación del genoma, que ya se han completado o están a punto de ser:
El 11 de enero de 2008, los Institutos Nacionales de Salud lanzaron, como parte de la Hoja de ruta de los NIH para la investigación médica , el “ Proyecto de microbioma humano” . Su objetivo es secuenciar, en cinco años, el genoma de mil microbiotas humanas y analizar su papel en la salud y la enfermedad humanas.
El 11 de abril de 2008 se lanzó el proyecto europeo MetaHIT. Coordinado por el INRA , tiene como objetivo estudiar el genoma de todas las bacterias que constituyen la flora intestinal humana con el fin de caracterizar sus funciones y sus implicaciones en la salud .