Enterococcus
Enterococcus
Enterococcus
Enterococcus en tejido pulmonar
| Reinado | Bacterias |
|---|---|
| División | Firmicutes |
| Clase | Bacilos |
| Pedido | Lactobacillales |
| Familia | Enterococcaceae |
(ex Thiercelin & Jouhaud 1903 )
Schleifer & Kilpper-Bälz 1984
Los enterococos son cáscaras de metabolismo aero-anaeróbico, digamos cocos a grampositivos, generalmente en forma de cadenas. Son patógenos oportunistas que causan septicemia, infecciones del tracto urinario o infecciones abdominales de origen intestinal. Son la causa de más del 10% de las infecciones nosocomiales .
Durante mucho tiempo, los enterococos se clasificaron dentro del género Streptococcus , hasta 1984, cuando el análisis del genoma indicó que era más apropiado crear el género Enterococcus. Esta fusión se debe en particular al hecho de que los enterococos poseen el antígeno de la pared D, compartido por bacterias del género Streptococcus ( Streptococcus gallolyticus , Streptococcus infantarius, etc.). El género Enterococcus y el subgénero Streptococcus D pueden diferenciarse por la salinidad de un medio de cultivo. De hecho, el Enterococcus se puede cultivar en un medio hipersalino (6,5% de Nacl).
Las dos especies principales son Enterococcus faecalis y Enterococcus faecium .
Son bastante resistentes a los ácidos, lo que les permite atravesar la barrera del estómago .
En el agua potable , estos son indicadores de contaminación fecal , como E. coli .
Algunas cepas son resistentes a los antibióticos . Su resistencia a determinados antibióticos y su perfil de virulencia varían según las cepas aisladas. Los pacientes también pueden ser más o menos vulnerables.
Habitat
Como sugiere su nombre (entérico + caparazón), forman parte de la flora comensal y se encuentran en particular en el tracto digestivo y genitourinario (incluida la uretra).
Ecología
La ecología de los enterococos es diferente a la de los estreptococos y su adaptación al medio intestinal, donde normalmente son comensales minoritarios, les confiere una serie de propiedades diferentes a las de los estreptococos. En particular, son más resistentes en ambientes exteriores. Al igual que con E. coli , su presencia en el agua potable o en los alimentos es un indicio de contaminación fecal .
La aparición de cepas resistentes a los antibióticos probablemente se ha visto favorecida por el uso de antibióticos, en humanos, pero también en uso veterinario y por la agricultura y la industria alimentaria ( vancomicina y otros glicopéptidos ). Por ejemplo, el uso de avoparcina (un glicopéptido ampliamente utilizado en Europa pero no en los Estados Unidos o Canadá) durante más de 20 años como factor de crecimiento en la suplementación alimentaria de animales de granja ha permitido seleccionar enterococos de tipo VANA resistentes a ambos. vancomicina y avoparcina. El aislamiento de enterococos VANA de excrementos de cerdos y pollos de granjas alemanas y danesas que utilizan avoparcina, mientras que los enterococos aislados de granjas que no utilizan antibióticos en la suplementación animal son sensibles a los glicopéptidos, apoya esta hipótesis.
Diagnóstico bacteriológico
Los enterococos son cocos grampositivos caracterizados por un cierto polimorfismo: conchas a menudo de tamaño desigual, en diplocococos o cadenas cortas. Están inmóviles y sin cápsula.
No son bacterias exigentes y pueden crecer en placas de agar normales. Su cultivo es más fácil y abundante que el de los estreptococos. Muestran turbidez en caldo y colonias ligeramente opalescentes de más o menos 1,5 mm en agar. En agar sangre , las colonias pueden ser no hemolíticas o α-hemolíticas. En un medio de bilis-esculina , los enterococos se desarrollan hidrolizando la esculina (halo negro).
Los enterococos pertenecen al grupo D de la clasificación de Lancefield (Ag D es común a muchos taxones) y son PYR positivos. Para todas las bacterias del grupo D de Lancefield, el carácter hemolítico pierde su importancia desde el punto de vista de la patogenicidad. Es especialmente en infecciones del tracto urinario, abscesos abdominales o hemocultivos donde la presencia de un germen " viridans " debe sugerir un enterococo.
El medio más utilizado para la detección de enterococos es el medio de bilis-esculina .
Los enterococos (pero también los lactobacilos y la listeria , que afortunadamente no son berberechos) crecen al volver el medio a negro: el ennegrecimiento del medio refleja la hidrólisis de la esculina en el esculetín que se une al hierro III.
Los personajes principales que los diferencian de los estreptococos son:
- resisten 1/2 hora a 60 ° C ;
- pueden crecer entre 10 y 40 ° C (estreptococos: 37 ° C );
- pueden crecer en caldo con un 40% de bilis agregado ( se inhiben los estreptococos , se lisan los neumococos );
- toleran hasta un 6,5% de NaCl;
- fermentan la esculina.
La identificación bioquímica puede utilizar una galería de tipo API 20 Strepto ( Biomérieux ). La primera parte prueba las enzimas y la producción de butanodiol, la segunda parte el uso de diferentes carbohidratos .
Las especies se identifican mediante PCR multiplex. Los fenotipos de resistencia a los glicopéptidos y la búsqueda de los principales genes de virulencia de las cepas aisladas.
Patogénesis
Las dos especies que se encuentran con mayor frecuencia en patología humana son: Enterococcus faecalis y Enterococcus faecium, que pueden ser fuente de infecciones en pacientes frágiles. Son bacterias patógenas oportunistas.
Las condiciones más comunes son:
- las infecciones urinarias y los abscesos abdominales donde se encuentran solos o en combinación con E. coli;
- la peritonitis ;
- infecciones secundarias de heridas quirúrgicas principalmente abdominales responsables de abscesos ;
- la endocarditis lenta o subaguda (5 a 10% especialmente en hombres mayores) que podría causar bacteriemia y septicemia .
Epidemiología
Las infecciones bacterianas ( bacteriemia ) por enterococos tienen fama de ser casi siempre infecciones de origen endógeno, lo que requiere estrategias adaptadas para controlar el riesgo nosocomial. En los hospitales, estas bacterias pueden ser responsables de infecciones nosocomiales graves, la primera de las cuales se detectó en Francia a mediados de los años ochenta.
Por ejemplo, un estudio prospectivo realizado en el Hospital Universitario de Nîmes en 2004-2005, se centró en 33 pacientes con una edad media de 68 años (3-96). Detectó 33 cepas de enterococos, nosocomiales en el 60,6% de los casos.
Las infecciones siguieron a una intervención quirúrgica en el 54,5% de los casos, y con un pronóstico vital en el 63,6% de los casos (7 de estos pacientes fallecieron durante su hospitalización, es decir, el 21,2% pero no se produjo ninguna epidemia). La entrada principal parecía digestiva, con un número significativo de infecciones relacionadas con el catéter .
Los factores comórbidos fueron cardiovasculares y digestivos.
Las infecciones fueron generalmente monomicrobianas (75,8%), debidas a Enterococus faecalis en el 87,9% de los casos.
En estos pacientes, los aislamientos de E. faecalis fueron destruidos por amoxicilina y glicopéptidos pero resistentes a antibióticos a norfloxacina , eritromicina y pristinamicina . Lo mismo ocurre con Enterococus faecium (también con un caso de resistencia significativa a la amoxicilina).
E. faecalis poseía un máximo de genes de virulencia a diferencia de E. faecium .
Diagnóstico biológico
El diagnóstico se realiza mediante el cultivo de muestras de varios tipos:
- orina,
- pus,
- líquido de punción,
- cultura de sangre,
- hisopo rectal para portadores sanos de enterococos resistentes a la vancomicina.
Tratamiento
Terapia con antibióticos
Una de las dificultades del tratamiento es la resistencia de los enterococos a muchos antibióticos.
- Los enterococos son resistentes a las cefalosporinas .
- Toleran las penicilinas, incluso en dosis elevadas (CMB / CMI> 32).
- Si el antibiograma muestra que la amoxicilina es activa sobre los enterococos, esto no significa que este antibiótico será bactericida. La concentración mínima inhibitoria (MIC) de penicilinas es de 10 a 100 veces mayor para los enterococos que para otros estreptococos debido a la baja afinidad del PLP por estos betalactámicos. Además, se considera que los enterococos son tolerantes a los betalactámicos, ya que estos gérmenes solo mueren con concentraciones bactericidas mínimas (CMB) de antibióticos muy por encima de la CMI (CMB / CMI> 32).
- En infecciones graves (endocarditis, bacteriemia, etc.), es necesario utilizar una combinación de antibióticos:
- Ampicilina / gentamicina o
- Vancomicina / gentamicina .
En Francia, los enterococos resistentes a la vancomicina todavía parecen raros.
Fagoterapia
La terapia con fagos se usa en humanos en algunos países como Rusia y Georgia. En Rusia, puede encontrar un cóctel de bacteriófagos diseñado específicamente contra los estreptococos en farmacias y otros cócteles más generales que incluyen bacteriófagos antiestreptocócicos.
En Francia, la terapia con fagos solo es posible con una autorización de uso temporal emitida por la ANSM . Ante la falta de solución a través del circuito asistencial tradicional, se han creado organizaciones de pacientes en Francia para facilitar el acceso a bacteriófagos extranjeros.
Calidad del agua
Muchos países han promulgado regulaciones drásticas con respecto al agua del grifo y embotellada y al agua de baño. Por ejemplo, el estado de Hawái en los Estados Unidos impone una tasa de menos de 7 bacterias formadoras de colonias por 100 ml de agua, por encima del cual el estado puede publicar advertencias instando al público a permanecer fuera del agua. 'Océano.
En 2004, Enterococcus spp. ha tomado el lugar del grupo de coliformes fecales para la nueva norma federal para la calidad del agua de baño en las playas públicas, ya que este indicador se considera representativo de muchos otros patógenos fecales y se encuentra especialmente en las aguas residuales (alcantarillas, que pueden tener fugas o desbordes, especialmente en áreas de hundimiento minero y después de terremotos En algunos países, las aguas residuales, vertidas al medio ambiente natural sin tratamiento por una planta de tratamiento de aguas residuales , son un factor importante de contaminación.
Prevención, precaución
- El cribado sistemático ayuda a limitar el riesgo aguas arriba
- Se deben tomar estrictas medidas de higiene en los hospitales y alrededor de los pacientes en riesgo, particularmente en las unidades de cuidados intensivos (incluidas las neonatales), y por parte del personal de enfermería para limitar el riesgo de transmisión manual de enterococos resistentes a los antibióticos. La limpieza de las manos es muy importante, las soluciones hidroalcohólicas parecen limitar eficazmente los riesgos.
- Ciertos materiales y materiales pueden promover o, por el contrario, reducir la supervivencia de las bacterias en el medio ambiente.
- La modelización del riesgo nosocomial permite gestionarlo mejor
Lista de especies
Según la NHPS
En abril de 2021 se registraron las siguientes especies:
- Enterococcus faecalis (Andrewes & Horder 1906) Schleifer & Kilpper-Bälz 1984: descripción de la especie tipo del género, reclasificación de Streptococcus faecalis
- Enterococcus alcedinis Frolková et al. 2013
- Enterococcus aquimarinus Švec et al. 2005
- Enterococcus asini de Vaux et al. 1998
- Enterococcus avium (ex Nowlan y Deibel 1967) Collins et al. 1984
- Enterococcus bulliens Kadri et al. 2016
- Enterococcus caccae Carvalho et al. 2006
- Enterococcus camelliae Sukontasing et al. 2007
- Enterococcus canintestini Naser et al. 2005
- Enterococcus canis De Graef et al. 2003
- Enterococcus casseliflavus (ex Vaughan et al. 1979) Collins et al. 1984: reclasificación de E. flavescens
- Enterococcus cecorum (Devriese et al. 1983) Williams et al. 1989: reclasificación de Streptococcus cecorum
- Enterococcus columbae Devriese et al. 1993
- Enterococcus crotali McLaughlin et al. 2017
- Enterococcus devriesei Švec et al. 2005
- Enterococcus diestrammenae Kim et al. 2013
- Enterococcus dispar Collins et al. 1991
- Enterococcus dongliensis Li y Gu 2019
- Enterococcus durans (ex Sherman y 1937) Collins et al. 1984: reclasificación de Streptococcus durans
- Enterococcus eurekensis Cotta et al. 2013
- Enterococcus faecium (Orla-Jensen 1919) Schleifer & Kilpper-Bälz 1984: reclasificación de Streptococcus faecium
- Enterococcus florum Techo et al. 2019
- Enterococcus gallinarum (Bridge y Sneath 1982) Collins et al. 1984: reclasificación de Streptococcus gallinarum
- Enterococcus gilvus Tyrrell et al. 2002
- Enterococcus haemoperoxidus Švec et al. 2001
- Enterococcus hermanniensis Koort y col. 2004
- Enterococcus hirae Farrow y Collins 1985
- Enterococcus hulanensis Li y Gu 2019
- Enterococcus italicus Fortina et al. 2004: reclasificación de E. saccharominimus
- Enterococcus lactis Morandi y col. 2012
- Enterococcus lemanii Cotta et al. 2013
- Enterococcus malodoratus (ex Pette 1955) Collins et al. 1984
- Enterococcus moraviensis Švec et al. 2001
- Enterococcus mundtii Collins et al. 1986
- Enterococcus nangangensis Li & Gu 2019
- Enterococcus olivae Lucena-Padrós et al. 2014
- Enterococcus pallens Tyrrell et al. 2002
- Enterococcus phoeniculicola Law-Brown & Meyers 2003
- Enterococcus pingfangensis Li & Gu 2019
- Enterococcus plantarum Švec et al. 2012
- Enterococcus pseudoavium Collins et al. 1989
- Enterococcus quebecensis Sistek et al. 2012
- Enterococcus raffinosus Collins et al. 1989
- Enterococcus ratti Teixeira y col. 2001
- Enterococcus rivorum Niemi et al. 2012
- Enterococcus rotai Sedláček et al. 2013
- Enterococcus saccharolyticus (Farrow et al. 1985) Rodrigues y Collins 1991: reclasificación de Streptococcus saccharolyticus
- Enterococcus saignonensis Harada et al. 2016
- Enterococcus silesiacus Švec et al. 2006
- Enterococcus songbeiensis Li & Gu 2019
- Enterococcus sulfureus Martinez-Murcia y Collins 1991
- Enterococcus termitis Švec et al. 2006
- Enterococcus thailandicus Tanasupawat et al. 2008
- Enterococcus ureasiticus Sistek et al. 2012
- Enterococcus ureilyticus Sedláček et al. 2013
- Enterococcus viikkiensis Rahkila et al. 2011
- Enterococcus villorum Vancanneyt et al. 2001: reclasificación de E. porcinus
- Enterococcus wangshanyuanii Jin y col. 2017
- Enterococcus xiangfangensis Li y col. 2014
- Enterococcus xinjiangensis Ren y col. 2020
Algunas especies previamente contadas en Enterococci se han reclasificado en otros géneros:
- Lactococcus garvieae (Collins et al. 1984) Schleifer et al. 1986: reclasificación de E. seriolicida
- Tetragenococcus solitarius (Collins et al. 1989) Ennahar & Cai 2005: reclasificación de E. solitarius
Notas y referencias
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Ver también
Artículos relacionados
enlaces externos
- NosoBase y hoja específica
- Observatorio Nacional de Epidemiología de la Resistencia Bacteriana a los Antibióticos ( Onerba )
- Centros nacionales de referencia: http://www.pasteur.fr/sante/clre/cadrecnr/crab-index.html ;
- Sistema europeo de vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos (EARSS);
- [1]
Bibliografía
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