Genómica
La Genómica es una disciplina de la biología moderna. Estudia el funcionamiento de un organismo, un órgano, un cáncer , etc. a nivel del genoma , en lugar de limitarse a la escala de un solo gen .
La genómica se divide en dos ramas:
La genómica es el equivalente a la metabolómica de los metabolitos .
Historia
El desarrollo de esta disciplina se ha visto facilitado por el desarrollo de técnicas de secuenciación del genoma y bioinformática .
Utilidad
Conocer la secuencia de nucleótidos permite multitud de estudios:
Genómica estructural
Esta rama de la genómica incluye todos los análisis de la estructura de los genomas (aquí "estructura" se entiende en el sentido de "organización de genomas" ); Por tanto, los métodos en cuestión son la secuenciación de genomas, la identificación de genes, secuencias reguladoras, secuencias repetidas, etc.
Secuenciación del genoma
Anotación de genomas
La anotación del genoma es un análisis informático de las secuencias obtenidas en la secuenciación para identificar secuencias informativas de genomas. Estas secuencias son principalmente genes (esto se llama predicción genética ). La mayoría de estos se identifican ya sea por su similitud con genes ya conocidos, o mediante una predicción basada en la secuencia (la presencia de un marco de lectura abierto se caracteriza por un codón de inicio de la traducción , a continuación, al menos 100 codones y, finalmente, un codón de parada Pero también existen “genes fragmentados” (que contienen intrones ) o que codifican ARN funcionales, estos deben ser predichos por diferentes algoritmos.
Los genes no son los únicos objetivos de la anotación del genoma, hay muchos otros tipos de secuencias importantes en los genomas; secuencias reguladoras, elementos transponibles, etc.
Genómica funcional
Una vez anotados los genomas, el siguiente paso será la búsqueda de la función de las secuencias informativas identificadas. La genómica funcional se puede considerar como genética de "alto rendimiento". Las técnicas utilizadas serán comparables pero generalmente aplicadas a un gran número de genes en paralelo, esto puede ser, por ejemplo, la creación de mutantes y el análisis de sus fenotipos para toda una familia de genes , o el análisis de la expresión de todos. genes de un organismo completo.
Ejemplos de investigación genómica
en Francia
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Genoscopio : Centro Nacional de Secuenciación. Génoscope lideró la contribución francesa al proyecto internacional de secuenciación del genoma humano mediante la secuenciación del cromosoma 14.
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Genoscreen : biotecnología francesa especializada en genómica, Genoscreen lleva a cabo programas de investigación y desarrollo, en asociación con equipos de investigación académicos, en trabajos de interés para la salud humana a través de la investigación de determinantes genéticos de patologías neurodegenerativas, y el desarrollo de métodos e investigación. 'Herramientas moleculares para la tipificación y caracterización de microorganismos patógenos responsables de enfermedades infecciosas.
En Europa
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Marine Genomics Europe : esta red europea tiene como objetivo desarrollar la genómica marina, promover los intercambios entre investigadores en este campo, pero también desarrollar acciones de divulgación.
en el mundo
- El proyecto Barcode of Life : Paul Hebert ( Universidad de Guelph ( Ontario )) propuso construir una especie de biblioteca de especies utilizando códigos de barras genéticos que identifiquen potencialmente cada especie viva conocida a partir de un marcador (en animal , una región de 648 pares de bases en un gen ( CO1 ) del ADN mitocondrial ). A finales de 2007, 160 organizaciones de 50 países se habían unido a este proyecto, la base de datos ya comprende más de 318.000 series que describen cerca de 33.900 especies. Este enfoque tiene límites (confusión en caso de hibridación o si una especie ha divergido recientemente, información sobre la especie, pero no sobre su posición en el árbol filogenético) pero es de interés para las necesidades de trazabilidad (alimento, incluido el pescado que se vende a menudo bajo diferentes nombres para la misma especie), a numerosos estudios de ecología , para industrias biotecnológicas. Este trabajo también permite corregir errores en taxonomía . Por ejemplo, un solo nombre en realidad designaba a 3 especies diferentes de sanguijuelas medicinales europeas (incluidas Hirudo medicinalis , Hirudo verbana ) que podrían comercializarse, mientras que solo una ha sido bien estudiada por sus propiedades.
Notas y referencias
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Secuencia de nucleótidos del gen que codifica la proteína de la cubierta del bacteriófago MS2
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Proyecto BOLD (" Code Bar Of Life ")
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Hebert P y col. (2003) Proc Roy Soc Lond Ser B 270, 313-21
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Fuente: Biofutur, diciembre de 2007, n ° 283, página 6
Ver también
Artículos relacionados
enlaces externos