La Malesia es una región caballo biogeográfica en el ecuador y los límites de la ecozona Indomalaya y la ecozona Australasia y una región florística fitogeográfica del reino Paleotropical . Se le han dado diferentes definiciones. El Esquema Geográfico Global para el Registro de Distribuciones Vegetales separó a Papua en su versión de 2001.
Malesia se identificó por primera vez como una región florística que incluía la península malaya , el archipiélago malayo , Nueva Guinea y el archipiélago de Bismarck , sobre la base de una variedad compartida de flora tropical procedente principalmente de Asia , pero también con muchos elementos de la flora antártica, incluyendo muchas especies pertenecientes a las familias de coníferas del hemisferio sur, Podocarpaceae y Araucariaceae . La región florística cubre cuatro regiones distintas de fauna de mamíferos .
La primera edición del Esquema Geográfico Mundial para el Registro de Distribuciones Vegetales (WGSRPD) utilizó esta definición, pero en la segunda edición de 2001 Nueva Guinea y el Archipiélago de Bismarck fueron removidos de Malesia para reunirse con las Islas Salomón , previamente ubicadas Región del Pacífico sudoccidental WGSRPD. Estos tres elementos forman una nueva región, Papua .
La parte occidental de Malesia, que incluye la península de Malasia y las islas de Sumatra , Java , Bali y Borneo , comparte la gran fauna de mamíferos de Asia y se conoce como Sondeland . Estas islas están ubicadas en la plataforma continental relativamente poco profunda de Asia y estuvieron conectadas allí durante la Edad del Hielo , cuando los niveles del mar eran más bajos. El límite oriental de Sondeland es la Línea Wallace , que lleva el nombre del naturalista británico del siglo XIX Alfred Russel Wallace , quien notó la diferencia en la vida silvestre entre las islas a ambos lados de la línea. Las Dipterocarpaceae son los árboles predominantes en los bosques de tierras bajas de Sondeland.
La mayor parte de Filipinas nunca ha estado conectada con el continente asiático y tiene una flora predominantemente asiática, así como una fauna de mamíferos distinta.
Las islas entre Sundaland y Nueva Guinea, llamadas Wallaceae , nunca han estado conectadas con continentes vecinos y tienen flora y fauna, incluidos elementos de Indonesia y Australasia.
Las Islas Salomón, Nueva Guinea y el archipiélago de Bismarck se colocan juntos en Papúa en lugar de en Malesia en la segunda versión del WGSRPD. La parte oriental de la antigua definición de Malesia, que incluye Nueva Guinea y las islas Aru del este de Indonesia, está conectada a Australia por una plataforma continental poco profunda y comparte muchos taxones de mamíferos y aves marsupiales con Australia. Nueva Guinea también tiene muchos otros elementos de la flora antártica, como el haya del sur ( Nothofagus ) y los eucaliptos . Nueva Guinea tiene las montañas más altas de Malesia y Papuasia, y su vegetación va desde la selva tropical de las tierras bajas hasta la tundra.