Distancia genética (genética de poblaciones)

En taxonomía , la distancia genética es una medida de la divergencia genética entre dos poblaciones o moléculas .

Históricamente, esta medida solo se deducía de las diferencias de frecuencia de los alelos , pero hoy en día también se usa a veces otra información.

Métodos de cálculo

Se han propuesto varios métodos para calcular la distancia genética. Los más comunes se indican aquí.

A lo largo de este artículo, notaremos y las dos poblaciones estudiadas, y respectivamente, y las frecuencias para el alelo u-ésimo de los loci l-ésimo. Examinamos los loci. X{\ Displaystyle X}Y{\ Displaystyle Y}Xtu{\ Displaystyle X_ {u}}Ytu{\ Displaystyle Y_ {u}}L{\ Displaystyle L}

La distancia genética de Nei

Esta medida fue propuesta en 1972 por el biólogo japonés-estadounidense Masatoshi Nei en la siguiente forma:

D=-en⁡∑l∑tuXtuYtu(∑l∑tuXtu2)(∑l∑tuYtu2){\ Displaystyle {\ begin {alineado} D = - \ ln {\ frac {\ sum \ límites _ {l} \ sum \ limits _ {u} X_ {u} Y_ {u}} {\ sqrt {(\ sum \ límites _ {l} \ suma \ límites _ {u} X_ {u} ^ {2}) (\ suma \ límites _ {l} \ suma \ límites _ {u} Y_ {u} ^ {2})} }} \ end {alineado}}}

D{\ Displaystyle D}varía entre 0 e infinito. Este modelo asume que las diferencias genéticas entre las dos poblaciones se deben a la deriva genética y las mutaciones.

Representaciones gráficas

A menudo queremos comparar más de cuatro poblaciones o moléculas, lo que plantea el problema de una representación eficiente de estos datos. La solución generalmente adoptada consiste en reducir los datos a una representación en dos o tres dimensiones, utilizando métodos desarrollados en estadística multivariante , y en particular el análisis de componentes principales .

Uso en filogenia

Ver también

• Índice de fijación ( )FST{\ Displaystyle F_ {ST}}

Notas y referencias

Referencias

• (en) Mark Jobling, Edward Hollox, Matthew Hurles, Toomas Kivisild y hris Tyler-Smith, Human Evolutionary Genetics: Segunda edición , Nueva York y Londres, Garland Science,2014, 690  p. ( ISBN  978-0-8153-4148-2 ) , "6.3. MEDICIÓN DE LA DISTANCIA GENÉTICA ”, págs. 173-182

1. p. 173
2. “La distancia genética y la estructura de la población se pueden representar mediante análisis multivariados”, p. 179-180

• otras referencias

1. (en) Nei, M., "  distancia genética entre las poblaciones  " , Am. Nat. , vol.  106,1972, p.  283–292 ( DOI  10.1086 / 282771 )

Notas