Un puerto natural es una hendidura en un litoral como una cala , bahía , estuario , fiordo , etc. permitiendo que los barcos atraquen y se refugien allí . El calado y las dimensiones del puerto natural que permitan maniobras (atraque, virajes, etc.) determinarán el tamaño de las embarcaciones que podrán utilizarlo.
Un puerto natural puede ser luego parcial o totalmente artificial ; que se opone a los puertos construidos ex nihilo , ya sea mediante la creación de un muelle por el dragado y excavación de la costa o mediante la construcción de diques y escolleras en frente de ella.