Las exoribonucleasas son enzimas tanto de tipo exonucleasa como ribonucleasa , es decir, enzimas que degradan el ARN por eliminación de nucleótidos terminales, o del extremo 5 ' , o del extremo 3' de la molécula de ARN. Las enzimas que cortan los nucleótidos del extremo 5 'se denominan exoribonucleasas 5'-3' y las enzimas que cortan los nucleótidos del extremo 3 'se denominan exoribonucleasas 3'-5' .
Las exoribonucleasas se pueden usar para separar los enlaces internucleotídicos ya sea agua (esto se llama actividad hidrolítica) o fosfatos inorgánicos (llamada actividad fosforolítica). Las exoribonucleasas hidrolíticas llevan el número EC 3.1 y las exoribonucleasas fosforolíticas llevan el número EC 2.7.7. El uso de enzimas fosforolíticas (que usan un fosfato inorgánico como cofactor) da como resultado la liberación de nucleótidos difosfatos mientras que las enzimas hidrolíticas (que usan agua como cofactor) producen la liberación de nucleótidos monosfosfatos.
Las exoribonucleasas se encuentran en todos los reinos vivientes: bacterias , arqueas y eucariotas . Las exoribonucleasas están implicadas en la degradación de diferentes especies de ARN como los ARN mensajeros , los ARN de transferencia y los ARN ribosomales .
Pueden estar formados tanto por una única proteína (como es el caso de la RNasa D o la RNasa PH ), como por varias proteínas formando complejos proteicos, como los exosomas en los que encontramos cuatro grandes familias de exoribonucleasas.
| Familia | Ejemplos de | Distribución | Actividad enzimática |
|---|---|---|---|
| RNR | RNasa R | La mayoría de las bacterias, todos los eucariotas | hidrólisis 3'-5 ' |
| ARNasa II | |||
| Rrp44 | |||
| DEDD | ARNasa D | Algunas bacterias, todas eucariotas | hidrólisis 3'-5 ' |
| RNasa T | |||
| PM / Scl-100 | |||
| Oligoribonucleasa | |||
| RBN | RNasa BN | Algunas bacterias | hidrólisis 3'-5 ' |
| PDX | PNPase | Todos los reinos | fosforolisis 3'-5 ' |
| PM / Scl-75 | |||
| RNasa PH | |||
| PVP4 | Rrp4 | Todos los eucariotas, la mayoría de las arqueas | hidrólisis 3'-5 ' |
| 5PX | Exoribonucleasa I | Todos los eucariotas | hidrólisis 5'-3 ' |
| Exoribonucleasa II |