El cristianismo en Azerbaiyán es una religión minoritaria. Los cristianos representan el 4.8% de la población del país. El 2,5% de la población pertenece a la Iglesia Ortodoxa Rusa (1998), afiliada a una Eparquía Ortodoxa Rusa.
El cristianismo se ha extendido al Cáucaso Albania, que es el territorio de Azerbaiyán en la época apostólica. La primera etapa de este período se denomina período de los apóstoles Bartolomé y Tadeo , quienes difundieron la nueva religión con la bendición del primer Patriarca de Jerusalén para luego dar a luz a la Iglesia albanesa . La primera iglesia se erigió en el pueblo de Kich. La iglesia de Kish fue construida antes de la primera iglesia cristiana armenia.
El número de protestantes se estima en menos de 7 000. Hay una comunidad luterana alemana en Bakú .
Misioneros católicos llegaron a Azerbaiyán desde el XIV ° siglo. A principios del XX ° siglo, Azerbaiyán , vivió en Bakú una comunidad de diez mil católicos polaco , ruso y alemán . La única iglesia (construida en 1912) se cerró cuando llegaron los bolcheviques y luego fue demolida en 1931 ; su sacerdote fue asesinado. Sin embargo, en el año 1992 un sacerdote eslovaco vino a Bakú para fundar una comunidad. El Papa Juan Pablo II visitó Azerbaiyán en 2002 . Hoy, la comunidad católica tiene 400 fieles indígenas y mil extranjeros viven en Azerbaiyán . Solo existe una parroquia.
Hay once comunidades. Los moloques son una minoría cristiana que, como los protestantes en Europa occidental , centran sus creencias en la Biblia y rechazan la jerarquía de las iglesias.