Succinato deshidrogenasa

Succinato deshidrogenasa
Imagen ilustrativa del artículo Succinato deshidrogenasa
Estructura tridimensional de una succinato deshidrogenasa de E. coli que muestra la ubicación de los cofactores  : se reconocen desde abajo hacia arriba el FAD , tres centros de hierro-azufre [2Fe-2S], [4Fe-4S] y [3Fe-4S], ubiquinona y el grupo hemo ( PDB  1NEK ). Las subunidades se identifican por un color: SdhA en verde, SdhB en azul, SdhC en rosa y SdhD en amarillo.
Principales características
Nombre aprobado Complejo succinato deshidrogenasa
Símbolo SDH
EC No. 1.3.5.1
Subunidad
A del gen SDHA , flavoproteína
Homo sapiens
Lugar 5 p. 15,33
Peso molecular 72 692  Da
Número de residuos 664  aminoácidos
Enlaces accesibles desde GeneCards y HUGO .
Adelante 6389
HUGO 10680
OMIM 600857
UniProt P31040
RefSeq ( ARNm ) NM_001294332.1 , NM_004168.3
RefSeq ( proteína ) NP_001281261.1 , NP_004159.2
Juntos ENSG00000073578

GENATLAS GeneTests GoPubmed HCOP H-InvDB Treefam Vega

Subunidad del gen B de SDHB
, proteína hierro-azufre
Homo sapiens
Lugar 1 p. 36,13
Peso molecular 31 630  Da
Número de residuos 280  aminoácidos
Enlaces accesibles desde GeneCards y HUGO .
Adelante 6390
HUGO 10681
OMIM 185470
UniProt P21912
RefSeq ( ARNm ) NM_003000.2
RefSeq ( proteína ) NP_002991.2
Juntos ENSG00000117118

GENATLAS GeneTests GoPubmed HCOP H-InvDB Treefam Vega

Subunidad del gen C de SDHC
, proteína de membrana
Homo sapiens
Lugar 1 q 23,3
Peso molecular 18 610  Da
Número de residuos 169  aminoácidos
Enlaces accesibles desde GeneCards y HUGO .
Adelante 6391
HUGO 10682
OMIM 602413
UniProt Q99643
RefSeq ( ARNm ) NM_001035511.1 , NM_001035512.1 , NM_001035513.1 , NM_001278172.1 , NM_003001.3
RefSeq ( proteína ) NP_001030588.1 , NP_001030589.1 , NP_001030590.1 , NP_001265101.1 , NP_002992.1
Juntos ENSG00000143252

GENATLAS GeneTests GoPubmed HCOP H-InvDB Treefam Vega

Subunidad del gen D de SDHD
, proteína de membrana
Homo sapiens
Lugar 11 q 23,1
Peso molecular 17 043  Da
Número de residuos 159  aminoácidos
Enlaces accesibles desde GeneCards y HUGO .
Adelante 6392
HUGO 10683
OMIM 602690
UniProt O14521
RefSeq ( ARNm ) NM_001276503.1 , NM_001276504.1 , NM_001276506.1 , NM_003002.3
RefSeq ( proteína ) NP_001263432.1 , NP_001263433.1 , NP_001263435.1 , NP_002993.1
Juntos ENSG00000204370

GENATLAS GeneTests GoPubmed HCOP H-InvDB Treefam Vega

La succinato deshidrogenasa ( SDH ), o complejo II de la cadena respiratoria , también llamado succinato-coenzima Q reductasa ( SQR ) es una membrana oxidorreductasa que cataliza la reacción  :

succinato + ubiquinona  fumarato + ubiquinol . 

Esta enzima está presente en un gran número de seres vivos. Por tanto, se encuentra en la membrana plasmática de las bacterias y en la membrana mitocondrial interna de los eucariotas , en particular de los mamíferos . Tiene la particularidad de involucrar tanto al ciclo de Krebs como a la cadena de transporte de electrones de la fosforilación oxidativa . Constituye el segundo punto de entrada de electrones con alto potencial de transferencia a la respiración celular y asegura la transferencia de electrones desde el succinato de la matriz mitocondrial a la coenzima Q 10.disuelto en la bicapa lipídica . En los seres humanos, se sabe que el bloqueo de la succinato deshidrogenasa causa enfermedades graves ( enfermedades neurodegenerativas o tumores), con un espectro muy amplio de síntomas típicos de las enfermedades mitocondriales .

Succinato deshidrogenasa (quinona) Llave de datos
EC No. EC 1.3.5.1
número CAS 9028-11-9
Cofactor (es) FAD  ; Fe-S
Actividad enzimática
IUBMB Entrada IUBMB
IntEnz Vista IntEnz
BRENDA Entrada BRENDA
KEGG Entrada KEGG
MetaCyc Camino metabólico
PRIAM Perfil
PDB Estructuras
IR AmiGO / EGO

Estructura y funcionamiento

La mayoría de las succinato deshidrogenasas de bacterias y mitocondrias constan de cuatro subunidades  : dos subunidades hidrófilas y dos subunidades hidrófobas . Las dos primeras son la flavoproteína SdhA y la proteína hierro-azufre SdhB, ubicadas en la matriz mitocondrial , mientras que las dos últimas se denominan SdhC y SdhD y forman el ancla de membrana de la enzima. SdhA contiene la adenina dinucleótido flavina (FAD) cofactor , así como el succinato de sitio de unión , mientras que SDHB contiene tres centros de hierro-azufre  : [2Fe-2S], [4Fe-4S] y [3FE-4S]. Hay dos isoformas distintas de la subunidad SdhA en humanos (subunidades Fp tipo I y tipo II ), también presentes en Ascaris suum (en) y Caenorhabditis elegans . Las subunidades SdhC y SdhD forman un complejo de membrana con el citocromo b que comprende seis hélices transmembrana, un hemo by un sitio de unión de ubiquinona . También se encuentra una molécula de cardiolipina y una molécula de fosfatidiletanolamina que ocupan el volumen hidrófobo por debajo del hemo en las subunidades SdhC y SdhD.  

Inhibidores

Hay dos clases distintas de inhibidores del complejo II  : los que bloquean la unión de ubiquinona y los que bloquean la unión de succinato.

Los SDHI son inhibidores que compiten con quinonas que tendrían el efecto de producir iones superóxido O 2 .. - y la aparición de estrés oxidativo . Al igual que con los antibióticos con bacterias, los hongos (mohos) pueden desarrollar resistencia, lo que hace que SDHI sea ineficaz con el tiempo.

Algunos hongos de importancia agrícola no son sensibles a los compuestos de la nueva generación de inhibidores de la unión del complejo II de ubiquinona.

Notas y referencias

  1. Los valores de masa y número de residuos indicados aquí son los del precursor de la proteína resultante de la traducción del gen , antes de las modificaciones postraduccionales , y pueden diferir significativamente de valores correspondientes para la proteína funcional.
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