Los flagelados o Flagellata (del latín flagellum = látigo) son organismos eucariotas unicelulares , que están equipados con flagelos que utilizan para la propulsión.
Algunos flagelados son heterótrofos , es decir, se alimentan de sustancias orgánicas, otros son autótrofos y realizan la fotosíntesis . Otros son mixotróficos : a veces heterótrofos, a veces autótrofos.
Debido a su movimiento activo, los flagelados heterótrofos antes se clasificaban entre los animales. Los flagelados fototróficos, como Euglena gracilis , se clasificaron luego como una forma intermedia entre animales y plantas. En la actualidad, los flagelados no pertenecen a animales ni a plantas; son protistas .
En la clasificación clásica, los flagelados se separaron en dos grupos taxonómicos: