Mapeo genético
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El mapeo genético es la construcción de una tarjeta que se localiza alrededor de un gen o base amplia en el genoma entero. De manera más general, es la determinación de la posición de un locus ( gen o marcador genético ) en un cromosoma en función de la tasa de recombinación genética . Su unidad de distancia es el centimorgan (cM).
Objetivo del mapeo genético
El acto de mapear implica determinar las posiciones relativas de los loci (genes o secuencias de ADN) en un cromosoma . Los mapas de ligamiento se obtienen a partir de la frecuencia de recombinación entre loci . Los mapas físicos se obtienen generalmente mediante el uso de hibridación in situ de fragmentos de ADN clonados con cromosomas en metafase , o el uso de híbridos somáticos o de irradiación.
Historia del mapeo genético
El primer mapa genético fue realizado en 1913 por Thomas Hunt Morgan y Alfred Sturtevant en el cromosoma X de Drosophila . La primera planta mapeada fue el maíz en 1935 utilizando la técnica de marcadores fenotípicos. La técnica del marcaje molecular es mucho más reciente.
Tipos de cartas
Siendo un mapa un diagrama que representa la posición relativa de los loci en un cromosoma y las distancias entre ellos, distinguimos los siguientes tipos de mapas:
- Un mapa genético es una alineación lineal de genes en un cromosoma, basada en frecuencias de recombinación (mapa de ligamiento) o ubicación física (mapa físico o cromosómico). Los términos mapa factorial o mapa estadístico se utilizan a menudo como sinónimos de mapa genético. Un mapa genético también se denomina mapa de recombinación meiótica .
- Un mapa de ligamiento es un diagrama lineal o circular que representa las posiciones relativas de genes en un cromosoma que están determinadas por la fracción de recombinación.
- Un mapa físico o mapa cromosómico lleva la indicación de la separación, en pares de bases (a menudo abreviado como bp ), entre pares de loci enlazados.
- Un mapa de restricción muestra la disposición lineal de los sitios de reconocimiento de endonucleasas de restricción a lo largo de una molécula de ADN .
- Un mapa óptico permite visualizar la composición genómica o cromosómica a una escala más general que la secuenciación.
Los mapas citológicos de genes asociados a mutaciones se pueden realizar cuando determinadas mutaciones cromosómicas tienen un soporte que se puede detectar mediante técnicas de tinción de tiras de cromosomas.
Tipos de mapas
El mapeo comparativo es la comparación de la ubicación de genes y marcadores en el mapa cromosómico entre especies . En las comparaciones entre especies estrechamente relacionadas, encontramos un alto grado de conservación:
- colinealidad: fenómeno por el cual se conserva el orden de los genes entre diferentes especies.
- de sintenia : presencia simultánea en el mismo cromosoma dos o más locus, independientemente de su ligamiento genético. La noción de sintenia se utiliza cada vez más para describir la conservación del orden de los genes entre dos especies relacionadas.
En este caso, la ubicación de varios genes se puede predecir utilizando un modelo de datos. Las comparaciones entre especies filogenéticamente distantes revelan un aumento en la pérdida de sintenia.
El mapeo S1 es un método para caracterizar los cambios postranscripcionales en el ARN ( corte y empalme de intrones , etc.) mediante la hibridación del ARN con un ADN monocatenario y el tratamiento con nucleasa S1.
Notas y referencias
- La disposición lineal de seis factores ligados al sexo en Drosophila , como lo muestra su modo de asociación [PDF] Journal of Experimental Zoology , 14: 43-59, 1913
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