La biogeoquímica es el estudio del proceso de transferencia cíclica de los elementos químicos del medio desde los abióticos a los organismos que a su vez retransmiten sus componentes al medio. (Traducción al francés del artículo de Odum, 1971)
Esta noción fue "inventada" por el científico ruso Vladimir Vernadsky .
Diversos análisis moleculares permiten calificar la naturaleza biogeoquímica de la materia orgánica, como el análisis de azúcares , lípidos y fenoles en la lignina . La cuantificación de estas moléculas permite evaluar la actividad biológica en diferentes entornos geológicos (turba, sedimentos, suelos forestales, aguas subterráneas, agua de lagos, etc.).
La concentración en el suelo de especies químicas derivadas de la orina se utilizó por primera vez en 2019 para estudiar el sitio prehistórico de Aşıklı Höyük y, más particularmente, el número de individuos y cabezas de ganado presentes.