Secuencia cis
Una secuencia cis es una secuencia de ADN capaz de modular la expresión de un gen presente (en general) en el mismo cromosoma .
La noción de secuencia cis se opone a la de factor trans que designa los factores de transcripción que actúan sobre estas secuencias cis.
Descubrimiento
Históricamente, la definición de factores cis es experimental: un factor actúa en cis si no se puede transcomplementar , es decir que no se obtiene el efecto de modulación si se transfecta un plásmido que contiene la secuencia correspondiente asociada a un promotor en la célula.
Elementos reguladores cis
Definición general
- Secuencias de menos de 20 nucleótidos;
- la mayoría de las veces se localiza corriente arriba del sitio de iniciación (con algunas excepciones: regulación corriente arriba del gen en la región 5'UTR, es decir, 'en la región promotora del gen);
- algunas de estas secuencias confieren especificidad de expresión tisular a los genes que las poseen;
- otros son el objetivo de factores transcripcionales ( factor trans ) cuya unión o activación está bajo el control de estímulos intra o extracelulares (como las hormonas, por ejemplo).
Diferentes regiones cis
Hay dos tipos de secuencias CIS que actúan en la regulación de genes:
- Secuencias reguladoras cis con una posición perfectamente definida
- Secuencias reguladoras cis con localización variable
Secuencias de posiciones perfectamente definidas
Secuencias de localización variable
- A menudo, muy alejado del gen: corriente arriba / corriente abajo / en los intrones o en otra hebra de ADN.
Incluye dos tipos especiales:
- Secuencia estimulador = potenciadores , que permiten la activación de ciertos genes en tejidos particulares.
- Secuencia inhibidora = silenciadores , implicados en la represión de genes.