El Alto Nilo es una región ubicada en el noreste de Sudán del Sur .
La región está formada por los estados de Jonglei , Unity y Alto Nilo , y las áreas administrativas de Ruweng (en) y Pibor (en) . Tiene una frontera con Etiopía al este y Sudán al norte.
La región del Alto Nilo se separó de la República de Sudán el 9 de julio de 2011, junto con las regiones de Bahr el-Ghazal y Equatoria . Las tres regiones constituyen ahora la República de Sudán del Sur.