El territorio de la Unión de las Comoras se divide en 3 islas autónomas y estas en 54 municipios (Ley n. ° 11-006 / AU de2 de mayo de 2011, promulgado el 21 de julio de 2011). Por razones administrativas, los municipios se agrupan en 16 prefecturas , distribuidas de la siguiente manera:
Isla autónoma de Gran Comora (Ngazidja)