La base de datos MetaCyc contiene una gran cantidad de información sobre el metabolismo y las enzimas de muchos seres vivos: estructura de enzimas, cofactores, activadores e inhibidores, especificidades de sustrato y, en algunos casos, constantes cinéticas. También proporciona comentarios y referencias en la literatura. MetaCyc recopila principalmente datos experimentales sobre vías metabólicas.
MetaCyc se utiliza como un conjunto de datos de referencia para predecir el metabolismo de los seres vivos basándose en la secuenciación de su genoma ; este ha sido el caso de cientos de organismos, incluidos los de la colección de bases de datos BioCyc .