La cuenca del Indo-Pacífico es una región biogeográfica oceánica que incluye los trópicos y subtrópicos del Océano Índico y la parte occidental del Océano Pacífico . Estos dos océanos tienen en común la misma fuente original principal de biodiversidad centrada en el archipiélago de Indonesia . Así, muchas especies marinas y costeras están representadas tanto en el Océano Índico como en el Pacífico, mientras que el Océano Atlántico, que no está vinculado a los anteriores por aguas tropicales, a menudo tiene una flora y fauna diferente.
La cuenca del Indo-Pacífico incluye los mares anexos, como el Mar Rojo , pero excluye las partes templadas y polares de ambos océanos, así como la parte oriental del Océano Pacífico a lo largo de las costas americanas , que constituye un dominio biogeográfico muy distinto ».