Hibridación genómica comparativa

La hibridación genómica comparativa (inglés, Comparative Genomic Hybridization o CGH ) es una técnica de citogenética molecular para analizar cambios en el número de copias en el ADN .

Principio

En un organismo diploide como los humanos, cada segmento de ADN se puede encontrar por duplicado: una copia está presente en cada uno de los dos cromosomas de un par . En determinadas patologías, el número de copias puede variar: puede aumentar por ejemplo en caso de duplicación y disminuir en caso de deleción . La hibridación genómica comparativa permite diagnosticar estas patologías e identificar las regiones cromosómicas implicadas.

Método

Marcado de sondas

El ADN de un paciente se extrae de tejido normal (principalmente linfocitos ) y tejido potencialmente tumoral y luego se marca con fluorocromos . En general, el ADN tumoral se marca en verde con fluoresceína (como dUTP-FITC) y el ADN de tejido sano en rojo con rodamina (como dUTP-TR).

A continuación, las sondas se mezclan con ADN Cot-1 , que permite eliminar las secuencias repetitivas de ADN , y una polimerasa, que permite producir fragmentos de 0,6 a 3 kb (miles de pares de bases).

Hibridación

La mezcla de ADN marcado se mezcla con ADN de control de metafase . El ADN marcado luego se hibridará competitivamente con el ADN metafásico:

Detección

A continuación, la fluorescencia se detecta mediante un microscopio de epifluorescencia y se cuantifica mediante análisis cuantitativo de imágenes .

Esta técnica es capaz de detectar pérdidas o ganancias en el número de copias de ADN a nivel cromosómico . En 2006, los puntos de referencia indicaron para la sensibilidad que se necesitaban regiones de 5-10 Mb (millones de pares de bases) para detectar la pérdida de una sola copia. Por otro lado, la detección de una amplificación fue posible a partir de 1 Mb.

Limitaciones y consideraciones técnicas

Aplicaciones

Ver también

enlaces externos