Espaciador transcrito interno

El espaciador transcrito interno (o espaciador transcrito interno (ITS) en inglés) es una porción del ADN ribosómico ubicado entre el gen de la subunidad pequeña y grande del ribosoma del ácido ribonucleico . Se utiliza en la filogenia de hongos o cianobacterias eucariotas y de códigos de barras de ADN .

Los espaciadores transcritos internos tienen tasas de mutación significativamente más altas como resultado de inserciones, deleciones y mutaciones puntuales , lo que hace inoperante una comparación de secuencias de ITS entre especies muy separadas, como los humanos y las ranas, por ejemplo. Sin embargo, se utiliza con éxito para análisis filogenéticos entre especies vecinas.

Ejemplo de uso del espaciador transcrito interno: el cladograma de especies de Caenorhabditis
Caenorhabditis

Elegans

C. inesperado



C. sp. 35


Elegans





C. briggsae



C. nigoni




C. sinica





C. latens



C. remanei






C. wallacei



C. tropicalis





C. brenneri



C. doughertyi





C. elegans



Rosal japonés





C. nouraguensis



C. yunquensis




C. macrosperma





C. afra



C. imperialis





C. japonica




C. kamaaina




Drosophilae




C. drosophilae



C. sp. 2






C. angaria



C. castelli




C. sp. 8






C. portoensis



C. virilis





C. guadeloupensis






C. monodelphis



C. plicata




Cladograma de especies de Caenorhabditis , basado en la comparación de secuencias del "Espaciador transcrito interno" según Félix et al. , 2014.

Histórico

Michel Delseny , director de investigación emérito del CNRS y miembro de la Académie des sciences, fue el primero en informar la secuencia espaciadora de genes que codifican los ARN ribosomales de una dicotiledónea en 1988 y en mostrar la base de la heterogeneidad de los genes ribosómicos en las plantas.

Notas y referencias

  1. (en) Masayuki Sumida, Yoji Kato y Atsushi Kurabayashi , "  Secuenciación y análisis de los espaciadores transcritos internos (ITSS) y regiones de codificación en el fragmento EcoRI del ADN ribosómico de la rana de estanque japonesa Rana nigromaculata  " , Genes & Genetic Systems , vol.  79, n o  2 Abril de 2004, p.  105-118 ( PMID  15215676 , DOI  10.1266 / ggs.79.105 , leer en línea )
  2. (en) Felix, Marie-Anne; Braendle, Christian; Cutter, Asher D. (11 de abril de 2014). "Un sistema simplificado para el diagnóstico de especies en Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) con designaciones de nombres para 15 especies biológicas distintas". MÁS UNO. 9: e94723. DOI : 10.1371 / journal.pone.0094723
  3. M. Delseny et al., "  Secuencia de heterogeneidad en genes de ARN ribosómico nuclear de rábano  ", Plant Sci. Letters , (1983), 30, pág.  107-111
  4. D. Delcasso-Tremousaygue et al., “  Caracterización estructural y transcripcional del espaciador externo de un gen nuclear de ARN ribosómico de una planta superior  ”, Eur. J. Biochem. , (1988), 172, pág.  767-776

enlaces externos