BRENDA
BRENDA es una base de datos sobre las enzimas . Es mantenido y desarrollado por el Instituto de Bioquímica de la Universidad de Colonia . Los datos sobre funciones enzimáticas se toman directamente de la literatura primaria. Los controles formales y los controles de coherencia se llevan a cabo mediante programas informáticos; además, cada uno de los datos introducidos se comprueba "manualmente". La última revisión se remonta aenero 2010 e incluyó:
- Aumento significativo de la velocidad de actualización.
- Desarrollo de un nuevo navegador de árbol EC
- Navegador de árbol de taxonomía
- Motor de búsqueda de subestructuras químicas para estructuras de ligandos
- Desarrollo de un vocabulario controlado
- Ontología de determinados campos de información
- Glosario de nombres de ligandos.
usar
La base de datos cubre 40 entradas, con información sobre la nomenclatura, reacciones, especificidad, estructura de la enzima, su método de aislamiento o preparación, referencias en la literatura científica y referencias cruzadas para secuencia o estructura 3D.
La base de datos es accesible de forma gratuita para usos académicos y sin fines de lucro, los usos comerciales deben tener licencia. Para utilizar la base de datos, es necesario registrarse por correo electrónico. La base de datos se puede buscar por nomenclatura CE , nombre de enzima, organismo o una búsqueda avanzada que combine estas entradas.
Otras bases de datos
Parte del texto en inglés que se traducirá al francés
Texto en inglés para traducir:
BRENDA también tiene enlaces a otras bases de datos. Incluido KEGG, que proporciona información sobre la vía en la que participa la enzima. También tiene enlaces a información de ontología genética a través del sitio web de GO. También hay enlaces a la literatura a través de PubMed. Otras bases de datos que BRENDA enlazan para incluir:
- FÁCIL
- Bases de datos NCBI (proteína, nucleótido, estructura, genoma, OMIM, dominios
- Nomenclatura de la enzima IUBMB
- Base de datos PDB (información 3D)
- PROSIDAD
- SISTEMAS
- Base de datos de proteínas mutantes
- SCOP
- CATH
- InterPro
Referencias
- Springer Handbook of Enzymes, Schomburg, D., Schomburg, I. (2001) 2 d Ed. Springer, Heidelberg
- Datos enzimáticos e información metabólica: BRENDA, un recurso para la investigación en biología, bioquímica y medicina Schomburg, I., Hofmann, O., Bänsch, C., Chang, A., Schomburg, D. Gene Funct. Decir. (2000) 3-4, 109-18
- BRENDA, datos enzimáticos e información metabólica. Schomburg, I., Chang, A., Schomburg, D. Nucleic Acids Res. (2002) 30, 47-9
- BRENDA: un recurso para datos enzimáticos e información metabólica. Schomburg I., Chang A., Hofmann O., Ebeling C., Ehrentreich F., Schomburg D. Trends Biochem. Sci. Enero de 2002; 27 (1): 54-6.
- Revisión de la base de datos BRENDA. Pharkya P., Nikolaev EV, Maranas CD Metab Eng. Abril de 2003; 5 (2): 71-3.
- BRENDA, la base de datos de enzimas: actualizaciones y novedades importantes. Schomburg I., Chang A., Ebeling C., Gremse M., Heldt C., Huhn G., Schomburg D. Nucleic Acids Res. 2004 1 de enero; 32 Edición de la base de datos: D431-3.